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simon二阶段设计样本量计算

simon二阶段设计样本量计算

作者: jamesjin63 | 来源:发表于2020-10-11 16:19 被阅读0次

    simon二阶段设计估计样本量

    II期临床试验是确定一种药物或方案是否具有足够的临床疗效的关键,需要进行更广泛的研究和开发。 在两阶段设计中,将患者分为两组或两个阶段。 在第一阶段完成时,将进行临时分析以确定是否应进行第二阶段。 如果有疗效的患者人数大于一定数量,则进行第二阶段。 否则,相反。


    image.png

    该文章是找到符合(p与检验效能-alpha与beta)标准下最小化预期样本量的设计。 该算法在Simon(1989)中进行了讨论。

    通过对Simon的工作总结,可以根据研究者需要,计算在特定疗效率下,满足检验指定检验效能下所需的最小样的本量。

    设计原理

    Simon二阶段设计原理:先对第一阶段的n_1例患者实施试验药,如果有效病例数小于或等于第一阶段临界值r_1,则不拒绝H_0,尚不能认为该药有效,需要终止试验。否则,另外n_2例患者进入第二阶段,对其实施试验药,如果在总的N例患者中总 N=n_1+n_2 的有效病例数(包括第一阶段的有效病例)小于或等于第二阶段临界值r,也不拒绝H_0,意思就是该药无效。否则,该药物可进入到下一期临床试验。

    • 第一阶段终止概率:
      PET_1=B(r;n,p)= \sum_{x\leq r} b(x;n,p)
    • 第二阶段终止概率:PET_2= \sum_{x=r+1} ^{min(n_1,r)} b(x;n_1,p)B(r-x;n_2,p)
    • 试验终止总概率:
      PET=PET_1+PET_2

    期望样本量为(Expected sample size,EN):
    EN=n_1+(1-PET_1)n_2
    表示在p_0 ,p_1 ,\alpha ,\beta相同条件下,重复试验所需的平均样本量,Simon二阶段设计就是在根据设定p_0 ,p_1 ,\alpha ,\beta条件下,计算最优、最小及最大样本量。
    以下是R语言的实现。

    library(ph2mult)
    help(ph2mult)
    
    binom.design(type = "admissible", p0 = 0.2, p1 = 0.6, 
                  signif.level = 0.05, power.level = 0.9,
                  plot.out = TRUE)
                  
               r1 n1 r  n   EN.p0.   PET.p0.      error     power
    Optimal     1  5 6 18  8.41536 0.7372800 0.03667360 0.9025229
    Admissible  1  6 5 14  8.75712 0.6553600 0.03943962 0.9184888
    Minimax     1  8 5 13 10.48342 0.5033165 0.02992795 0.9017176
    

    上述结果,就可以根据要求,计算出最小样本量了。

    参考

    1. Optimal two-stage designs for phase II clinical trials
    2. [PASS Sample Size Software](Two-Stage Phase II Clinical Trialsncss-wpengine.netdna-ssl.com)
    3. nph2mult: Phase II Clinical Trial Design for Multinomial Endpoints
    4. 肿瘤新药Ⅱ期临床试验常用二阶段设计的样本含量估计及其SAS实现

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