R基础 | Rstudio和R安装及更新

R安装

Rstudio安装：

1. 下载安装包
   进入Rstudio官网下载Rstudio Desktop。
   

选择自己电脑对应的系统版本下载。

2. 点击安装。

Rstudio中如何更新R：

mac用户

mac用户更新分两步。

1. 从CRAN下载最新的R pkg，安装后重启Rstudio。可以看到R version已经更新。
2. 转移已经安装的R包
   /Library/Frameworks/R.framework/Versions/x.xx/Resources/library
   x.xx为旧的版本号，换到新的版本号。
   注意新的版本文件夹下已经存在的包不要替换了。如果替换了看第3步
   路径可通过installed.packages()查看。
3. 更新所有转移的包
   update.packages(checkBuilt=TRUE)
4. 查看是否成功

version

用packageStatus查看目前所有包的情况。packagestatus对象包含两个表，一个是inst，即从library文件夹检测所有包目前的情况；一个是avail，是从CRAN站点看所有可安装包的情况。

ps <- packageStatus()
inst <- ps$inst
View(inst)

image.png
可以发现显示unavailable的都停留在3.4版本没有更新，看起来都是bioconductor里面的包。那么再更新一下bioconductor。结果高于3.5R版本不能用bioconductor了

看了一下bioconductor网站，要这样更新

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()

windows用户

install.packages("installr")

library(installr)

updateR()

R markdown

1. ctrl+alt+i 插入代码快捷方式
2. cheetsheet

菜单命令和快捷方式

• Edit -> Folding:
  • Collapse — Alt+L
  • Expand — Shift+Alt+L
  • Collapse All — Alt+O
  • Expand All — Shift+Alt+O
    Code:
  • Insert Section — Ctrl+Shift+R (Cmd+Shift+R on the Mac)
  • Jump To — Shift+Alt+J

入门R教程

1. swirl 包交互课程
   使用可参照 https://www.cognize.me/swirl/

参考

1. https://blog.csdn.net/to_Baidu/article/details/52904348#t8
2. 更新R
   https://www.linkedin.com/pulse/3-methods-update-r-rstudio-windows-mac-woratana-ngarmtrakulchol
3. R工作流程
   https://www.jianshu.com/p/986618e39239
4. 更新Rstudio和R