1.cmd中执行
cd C:\blast-2.9.0+\bin 变为在bin中执行
2.建库
C:\blast-2.9.0+\bin>makeblastdb.exe -in name.fa -dbtype prot -out name.db
3.比对
C:\blast-2.9.0+\bin>blastp.exe -query name.fa -out blast.out.txt -db name.db -evalue 1e-10 -outfmt 6
1.cmd中执行
cd C:\blast-2.9.0+\bin 变为在bin中执行
2.建库
C:\blast-2.9.0+\bin>makeblastdb.exe -in name.fa -dbtype prot -out name.db
3.比对
C:\blast-2.9.0+\bin>blastp.exe -query name.fa -out blast.out.txt -db name.db -evalue 1e-10 -outfmt 6
1.cmd中执行 cd C:\blast-2.9.0+\bin 变为在bin中执行 2.建库 C:\blast-2...
主要内容 1 背景 2 在线blast 3 本地blast 3.1 老版本blast 3.2 新版本bl...
建数据库：makeblastdb -in .\miR171.fa -input_type fasta -dbtyp...
为什么选用本地Blast： 我一直有个疑问，NCBI提供了简洁明了的交互式Blast操作界面，Genebank有着...
建立比对数据库makeblastdb -in Ms.Unigene.fa -dbtype nucl -pars...
安装BLAST mamba install -c bioconda blast 构建核酸BLAST数据库，这里因为...
建库 蛋白比对 提取ID seqkit fx2tab swiss-prot.tab -n -i >id.fa bl...
建库 -in：待格式化的序列文件-dbtype：数据库类型，prot或nucl-out：数据库名 比对 -quer...
本地blast后外显子拼接（好记性不如...） 利用TBtools工具进行本地blast大致可分为三大步骤...
blast 安装： 先在网上找到最新版的blast下载到本地；this is the download padg...
本文标题：本地Blast代码
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/fixvdhtx.html
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