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2021-05-06镉胁迫下高低镉基因型小麦的根比较转录组分析

2021-05-06镉胁迫下高低镉基因型小麦的根比较转录组分析

作者: 八段锦1134 | 来源:发表于2021-05-10 22:39 被阅读0次

背景

小麦是大宗作物,比其他大宗作物更容易吸收镉,镉对人体和植物都有很强的危害。
基本格式:介绍小麦、镉、转录组技术,最后一段说本研究做的是什么。

小麦中Cd可直接由根到粮食(从木质部到韧皮部的运输)?
为什么转录组数据 qRT-PCR验证?
测序数据用生物信息学手段分析后要用实验去验证。简单说,PCR设计引物判断某个DN片段是否存在。

研究内容

1 Cd胁迫处理,测定Cd含量
2 RNA测序分析
2个基因(Traes_3AL_CE3238869和Traes_4BL_1625AD8B8)在镉胁迫的低镉积累品种L17Cd中较空白L17CK表达上调,Cd胁迫促进了2个基因在小麦低Cd品种中表达,而在镉胁迫的高镉积累品种H17Cd中较空白H17CK表达下调(图4f)。Cd胁迫抑制了这2个基因在小麦低Cd品种中表达。
与空白L17CK和H17CK(图4)相比,Traes_4BL_13B1BC2C1在镉胁迫的低镉积累品种L17Cd中表达下调,Cd胁迫抑制了这个基因在小麦低Cd品种中表达,而在镉胁迫的高镉积累品种H17Cd中表达上调,Cd胁迫促进了这个基因在小麦高Cd品种中表达。

Go和KEGG分析的意义?

3 RT-PCR验证

结论

综上所述,本研究表明Cd处理后低Cd积累小麦中有1269个基因存在差异表达,而高Cd积累小麦中有399个基因存在差异表达。通过KEGG通路分析、GO-GO网络和pathwaypathway network分析,我们发现,小麦基因型H17的Cd积累高于L17,其Cd吸收和转运的效率更高,这依赖于ATP结合、抗氧化防御机制、苯丙素生物合成和植物激素信号转导等多种水平的Cd吸收和转运。我们的研究不仅为进一步研究小麦镉吸收提供分子机制,同样也为基因工程改造植物提供了新方向。

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