背景介绍

Cd的累积会对植物造成哪些影响：1光合作用；2离子代谢；3元素吸收。低Cd积累品种是在根部吸收少？还是根对镉截留较多，从而向地上部分转移的较少？本研究采用mRNA测序(RNA-seq)方法，比较了cd处理和空白对高低cd积累的菜心（B. parachinensis)品种的根和梢的影响，从而解决2个问题：1)Cd低积累品种应答机制相关的转录调控网络;2)Cd低积累菜心的可食用部分Cd吸收和积累能力低的遗传机制。

内容

1、选择10个基因进行qRT-PCR验证，以评估RNA-seq获得的基因表达数据的准确性。什么是qRT-PCR？
RT-qPCR由普通PCR技术发展而来，它是在传统PCR反应体系中加入荧光化学物质。怎么选基因：1选中高表达丰度基因。2、数目通常20个以上。有些可能结果不好就用不上。3、随机选（上调、下调、非差异都选），或性状相关关键基因（共同和特异表达差异基因等）根据FC值（fold change样品间差异倍数）计算的相关性R²评估标准通常为0.8。

另外又学到一个小技巧，就是excel里面不用拖公式，只要鼠标悬停在“+”处，双击就会自动填充公式计算了。
logFC值的R²一般会大于FC值，合并多组样品的logFC值的R²一般会大于单独一对或一组样品的。