Molecular Psychiatry（影响因子为11.973）上一篇《Depression phenotype identified by using single nucleotide exact amplicon sequence variants of the human gut microbiome》介绍了基于人肠道菌群的单核苷酸精确扩增子序列变异鉴定抑郁症表型。
原文资料：点击此处获取
1. 利用肠道菌群的单核苷酸精确扩增子序列变异（ASV）评估是否能从健康受试者（NODEP）中识别出抑郁症表型（DEPR）个体。
2.40例受试者粪便通过高通量肠道菌群测序（V3-V4，Miseq PE2*300）。在单核苷水平上，利用DADA2进行误差校正，结合PIME机器学习算法去噪，分类学水平分箱/解析现存的ASVs。ALDEx2进行丰度差异分析，评估效应值，PICRUSt2严格预测代谢途径。
3. 基于微生物分类学聚类与GABA、丁酸盐、谷氨酸盐、单胺类递质、单饱和脂肪酸和炎症成分的神经回路相关代谢途径网络分析，建立了一种多元机器学习方法，可以显著区分抑郁症表型个体和健康个体。
肠道菌群的单核苷酸精确扩增子序列变异与Metadata整体分析
分析图
健康受试者和抑郁症患者间代谢途径的差异
分析图
网友评论