写文章 1 GATK4.0和全基因组数据分析实践(上) 黄树嘉 关注 1.32018.02.21 14:39字数 ...
上次我们整理到bwa比对后得到bam文件,下一步我们要通过GATK流程从bam文件中call variant。 一...
####下载GRCm38 snp和indel vcf文件 #### ftp://ftp-mouse.sanger....
单倍型与单核苷酸多态性(SNP)有关,因此需先了解SNP。 单核苷酸多态(SNP):指在基因组水平上由单个核苷酸的...
我应该如何正确设置GATK VQSR的模型训练参数? | 《解螺旋技术交流圈》精华第4期 碱基矿工2018-07-...
一、SNP分析内容(包括但不局限):①call SNP的软件——freebayes;②计算全部SNP数量;③平均多...
1. SNP芯片 目前最常用的全基因组SNP分型方法,主流的SNP芯片: Illumina Infinium技术。...
SNP芯片的原理 Illumina的SNP芯片原理Illumina的SNP生物芯片的优势在于:第1,它的检测通量很...
Tag SNP 理论上,研究者通过对全部一千万个SNP位点都进行基因分型,也能够寻找到这样的区域。但是,目前用这种...
snp
本文标题:GATK-找snp上
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