PCOA NMDS

非约束性排序分析，而RDA,CCA，db-RDA属于约束性分析

PCA采用欧氏距离

NMDS 依据排列顺序（rank order）来定义距离。

NMDS 的计算步骤：

1. 在多维空间中定义点的位置。

2. 确定降维后的维度（通常是2维）。

3. 在2维中定义点的初始结构。

4. 比较 2D 中点的距离与计算出来的距离的差异。

5. 确定stress值。

6. 确定最优的stress值后，矫正每个点在2D图的位置。

关于stress值：

stress值记录了NMDS排序分析的应力函数值，stress值表示了 2维空间中点的距离与多维空间中点的距离的差异。stress会不断优化直到找到最优的stress值。

Stress应力（%）   拟合优度

20                      差

10                      一般

5                        好

2.5                     很好

0                        完美

RSQ一般要大于0.6.