PCA分析、PCoA分析,NMDS分析,CCA分析,RDA分析 16S测序和宏基因组测序中常用,用降维的思路对主要...
导读 本篇内容分为以下三块:(1)NMDS和PCoA分析:上一篇的多样性分析中介绍了利用QIIME2进行PCoA分...
非约束性排序分析,而RDA,CCA,db-RDA属于约束性分析 PCA采用欧氏距离 NMDS 依据排列顺序(ran...
微生物环境因子分析(RDA/db-RDA)-“ggvegan“介绍将环境因子引入微生物群落研究的CCA/RDA分析
前言 在microbiome analysis中,有着大量的A,诸如PCA,PCoA,RDA,CCA,ICA之类的...
引言 虽然通过PCoA或者NMDS等分析手段可以展示各组样本的微生物组成差异及组间差异,但是,这只是初步进...
一、关联分析 1. RDA/CCA分析 RDA或者CCA是基于对应分析发展而来的一种排序方法,将对应分析与多元回归...
目录 VIF方差膨胀因子分析 RDA/CCA分析 db-RDA分析 Mantel Test分析 相关性Heatma...
网站 http://www.qplot.cn:3838/apps/006-CCA_RDA/ RDA分析(Redun...
导入数据 PCoA 生成排序矩阵 碎石图来查看排名前几的轴的贡献率 NMDS 非度量多维尺度分析
本文标题:微生太 | 宏基因组分析(五)PCoA、NMDS、RDA/CCA
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rcznyctx.html
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