访问NCBI ftp 下载数据
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/
gene2ensembl，gene2accession， gene2pubmed，gene2go以及
gene_info信息文件，它们的核心连接是gene的entrez ID号
人类的：
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/GENE_INFO/Mammalia/Homo_sapiens.gene_info.gz
最主要的前几列
#tax_id #物种编号9606 是人类
#GeneID 基因ID 最新的；所以用旧的ID 无法转换，可以尝试参考中方法或者爬虫
#Symbol 基因名
#LocusTag 别名
#tax_id GeneID Symbol LocusTag
9606 1 A1BG - A1B|ABG|GAB|HYST2477
gene symbol 与 entrezid 转换
访问NCBI ftp 下载数据https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/[https://ftp...
参考Gene id 转换(四种基因各种id转换方法)[https://blog.csdn.net/weixin_4...
读取gene symbol 把symbol转换为ENTREZID GO富集分析 将GO富集结果写出到文件 ####...
ENTREZID SYMBOL ENSEMBLE 的相互转换 1 ID的转换 2 GO分析 3 KEGG分析
一、ENTREZID转换 进行功能注释，首先需要对差异基因deg数据集进行ENTREZID转换 二、输入数据准备 ...
方法一 ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对clusterProfiler）ID转换用到的...
富集分析：GO、KEGG id转换：bitr() 输入数据：差异基因的entrezid；所有基因的entrezid...
1 整理表格，使symbol转entrezid，利于后面的富集分析。 2 GO 分析 BP，MF and CC分别...
一、读取文件，ID转换 1.读取文件 2.ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对cluste...
本文标题：SYMBOL 与 ENTREZID转换
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