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K8S 有状态的应用和示例:多副本MySQL

K8S 有状态的应用和示例:多副本MySQL

作者: thepoy | 来源:发表于2021-05-27 13:21 被阅读0次

    本页展示如何使用 StatefulSet 控制器运行一个有状态的应用程序。此例是多副本的 MySQL 数据库。 示例应用的拓扑结构有一个主服务器和多个副本,使用异步的基于行(Row-Based) 的数据复制。

    说明:

    这不是生产环境下配置。 尤其注意,MySQL 设置都使用的是不安全的默认值,这是因为我们想把重点放在 Kubernetes 中运行有状态应用程序的一般模式上。

    一、准备

    你必须拥有一个 Kubernetes 的集群(至少 5 个子节点,1 主 4 子),同时你的 Kubernetes 集群必须带有 kubectl 命令行工具。

    如果你还没有集群,参考 用 kubeadm 在 Debian 或 Ubuntu 中创建 k8s 集群不要用 Debian,用 Ubuntu

    要完成本教程,你应该已经熟悉 PodServiceStatefulSet

    您正在使用默认命名空间或不包含任何冲突对象的另一个命名空间。

    二、目标

    • 使用 StatefulSet 控制器部署多副本 MySQL 拓扑架构。
    • 发送 MySQL 客户端请求
    • 观察对宕机的抵抗力
    • 扩缩 StatefulSet 的规模

    三、教程

    1 部署 MySQL

    MySQL 示例部署包含一个 ConfigMap、两个 Service 与一个 StatefulSet。

    1.1 ConfigMap

    使用以下的 YAML 配置文件创建 ConfigMap :

    mysql-configmap.yaml

    apiVersion: v1
    kind: ConfigMap
    metadata:
      name: mysql
      labels:
        app: mysql
    data:
      master.cnf: |
        # Apply this config only on the master.
        [mysqld]
        log-bin
        skip_name_resolve
      slave.cnf: |
        # Apply this config only on slaves.
        [mysqld]
        super-read-only
        skip_name_resolve
    
    kubectl apply -f ./mysql-configmap.yaml
    

    这个 ConfigMap 提供 my.cnf 覆盖设置,使你可以独立控制 MySQL 主服务器和从服务器的配置。 在这里,你希望主服务器能够将复制日志提供给副本服务器,并且希望副本服务器拒绝任何不是通过复制进行的写操作。

    ConfigMap 本身没有什么特别之处,因而也不会出现不同部分应用于不同的 Pod 的情况。 每个 Pod 都会在初始化时基于 StatefulSet 控制器提供的信息决定要查看的部分。

    1.2 服务

    使用以下 YAML 配置文件创建服务:

    mysql-services.yaml

    # Headless service for stable DNS entries of StatefulSet members.
    apiVersion: v1
    kind: Service
    metadata:
      name: mysql
      labels:
        app: mysql
    spec:
      ports:
      - name: mysql
        port: 3306
      clusterIP: None
      selector:
        app: mysql
    apiVersion: v1
    kind: PersistentVolume
    metadata:
      name: mysql-pv-2
      labels:
        type: local
    spec:
      capacity:
        storage: 10Gi
      accessModes:
        - ReadWriteOnce
      hostPath:
        path: "/tmp"
    apiVersion: apps/v1
    kind: StatefulSet
    metadata:
      name: mysql
    spec:
      selector:
        matchLabels:
          app: mysql
      serviceName: mysql
      replicas: 3
      template:
        metadata:
          labels:
            app: mysql
        spec:
          initContainers:
          - name: init-mysql
            image: mysql:5.7
            args:
              - "--ignore-db-dir=lost+found"
            command:
            - bash
            - "-c"
            - |
              set -ex
              # Generate mysql server-id from pod ordinal index.
              [[ `hostname` =~ -([0-9]+)$ ]] || exit 1
              ordinal=${BASH_REMATCH[1]}
              echo [mysqld] > /mnt/conf.d/server-id.cnf
              # Add an offset to avoid reserved server-id=0 value.
              echo server-id=$((100 + $ordinal)) >> /mnt/conf.d/server-id.cnf
              # Copy appropriate conf.d files from config-map to emptyDir.
              if [[ $ordinal -eq 0 ]]; then
                cp /mnt/config-map/master.cnf /mnt/conf.d/
              else
                cp /mnt/config-map/slave.cnf /mnt/conf.d/
              fi          
            volumeMounts:
            - name: conf
              mountPath: /mnt/conf.d
            - name: config-map
              mountPath: /mnt/config-map
          - name: clone-mysql
            image: registry.cn-hangzhou.aliyuncs.com/google_samples_thepoy/xtrabackup:1.0
            command:
            - bash
            - "-c"
            - |
              set -ex
              # Skip the clone if data already exists.
              [[ -d /var/lib/mysql/mysql ]] && exit 0
              # Skip the clone on master (ordinal index 0).
              [[ `hostname` =~ -([0-9]+)$ ]] || exit 1
              ordinal=${BASH_REMATCH[1]}
              [[ $ordinal -eq 0 ]] && exit 0
              # Clone data from previous peer.
              ncat --recv-only mysql-$(($ordinal-1)).mysql 3307 | xbstream -x -C /var/lib/mysql
              # Prepare the backup.
              xtrabackup --prepare --target-dir=/var/lib/mysql          
            volumeMounts:
            - name: data
              mountPath: /var/lib/mysql
              subPath: mysql
            - name: conf
              mountPath: /etc/mysql/conf.d
          containers:
          - name: mysql
            image: mysql:5.7
            args:
              - "--ignore-db-dir=lost+found"
            env:
            - name: MYSQL_ALLOW_EMPTY_PASSWORD
              value: "1"
            ports:
            - name: mysql
              containerPort: 3306
            volumeMounts:
            - name: data
              mountPath: /var/lib/mysql
              subPath: mysql
            - name: conf
              mountPath: /etc/mysql/conf.d
            resources:
              requests:
                cpu: 500m
                memory: 1Gi
            livenessProbe:
              exec:
                command: ["mysqladmin", "ping"]
              initialDelaySeconds: 30
              periodSeconds: 10
              timeoutSeconds: 5
            readinessProbe:
              exec:
                # Check we can execute queries over TCP (skip-networking is off).
                command: ["mysql", "-h", "127.0.0.1", "-e", "SELECT 1"]
              initialDelaySeconds: 5
              periodSeconds: 2
              timeoutSeconds: 1
          - name: xtrabackup
            image: registry.cn-hangzhou.aliyuncs.com/google_samples_thepoy/xtrabackup:1.0
            ports:
            - name: xtrabackup
              containerPort: 3307
            command:
            - bash
            - "-c"
            - |
              set -ex
              cd /var/lib/mysql
    
              # Determine binlog position of cloned data, if any.
              if [[ -f xtrabackup_slave_info && "x$(<xtrabackup_slave_info)" != "x" ]]; then
                # XtraBackup already generated a partial "CHANGE MASTER TO" query
                # because we're cloning from an existing slave. (Need to remove the tailing semicolon!)
                cat xtrabackup_slave_info | sed -E 's/;$//g' > change_master_to.sql.in
                # Ignore xtrabackup_binlog_info in this case (it's useless).
                rm -f xtrabackup_slave_info xtrabackup_binlog_info
              elif [[ -f xtrabackup_binlog_info ]]; then
                # We're cloning directly from master. Parse binlog position.
                [[ `cat xtrabackup_binlog_info` =~ ^(.*?)[[:space:]]+(.*?)$ ]] || exit 1
                rm -f xtrabackup_binlog_info xtrabackup_slave_info
                echo "CHANGE MASTER TO MASTER_LOG_FILE='${BASH_REMATCH[1]}',\
                      MASTER_LOG_POS=${BASH_REMATCH[2]}" > change_master_to.sql.in
              fi
    
              # Check if we need to complete a clone by starting replication.
              if [[ -f change_master_to.sql.in ]]; then
                echo "Waiting for mysqld to be ready (accepting connections)"
                until mysql -h 127.0.0.1 -e "SELECT 1"; do sleep 1; done
    
                echo "Initializing replication from clone position"
                mysql -h 127.0.0.1 \
                      -e "$(<change_master_to.sql.in), \
                              MASTER_HOST='mysql-0.mysql', \
                              MASTER_USER='root', \
                              MASTER_PASSWORD='', \
                              MASTER_CONNECT_RETRY=10; \
                            START SLAVE;" || exit 1
                # In case of container restart, attempt this at-most-once.
                mv change_master_to.sql.in change_master_to.sql.orig
              fi
    
              # Start a server to send backups when requested by peers.
              exec ncat --listen --keep-open --send-only --max-conns=1 3307 -c \
                "xtrabackup --backup --slave-info --stream=xbstream --host=127.0.0.1 --user=root"          
            volumeMounts:
            - name: data
              mountPath: /var/lib/mysql
              subPath: mysql
            - name: conf
              mountPath: /etc/mysql/conf.d
            resources:
              requests:
                cpu: 100m
                memory: 100Mi
          volumes:
          - name: conf
            emptyDir: {}
          - name: config-map
            configMap:
              name: mysql
      volumeClaimTemplates:
      - metadata:
          name: data
        spec:
          accessModes: ["ReadWriteOnce"]
          resources:
            requests:
              storage: 10Gi
    

    要使用 MySQL 5.6 镜像,不然在初始化时会出错。如果一定要使用 5.7 镜像,需要添加参数"--ignore-db-dir=lost+found"

    name: mysql
    image: mysql:5.7
    args:
      - "--ignore-db-dir=lost+found"
    
    kubectl apply -f ./mysql-statefulset.yaml
    

    你可以通过运行以下命令查看启动进度:

    kubectl get pods -l app=mysql --watch
    

    一段时间后,你应该看到 3 个 Pod 都进入了 Running 状态:

    NAME      READY   STATUS    RESTARTS   AGE
    mysql-0   2/2     Running   0          15m
    mysql-1   2/2     Running   0          15m
    mysql-2   2/2     Running   0          15m
    

    3 个副本分别运行在一个子节点上

    2 了解有状态的 Pod 初始化

    StatefulSet 控制器按序数索引顺序地启动每一个 Pod。 它一直等待前一个 Pod 准备好后才启动下一个 Pod。

    此外,控制器为每个 Pod 分配一个唯一、稳定的名称,形如 <statefulset 名称>-<序数索引>, 其结果是 Pods 名为 mysql-0mysql-1mysql-2

    上述 StatefulSet 清单中的 Pod 模板利用这些属性来执行 MySQL 副本的有序启动。

    2.1 生成配置

    在启动 Pod 规约中的任何容器之前,Pod 首先按顺序运行所有的 Init 容器

    第一个名为 init-mysql 的 Init 容器根据序号索引生成特殊的 MySQL 配置文件。

    该脚本通过从 Pod 名称的末尾提取索引来确定自己的序号索引,而 Pod 名称由 hostname 命令返回。 然后将序数(带有数字偏移量以避免保留值)保存到 MySQL conf.d 目录中的文件 server-id.cnf。 这一操作将 StatefulSet 所提供的唯一、稳定的标识转换为 MySQL 服务器的 ID, 而这些 ID 也是需要唯一性、稳定性保证的。

    通过将生成的配置文件复制到 conf.d 目录中,init-mysql 容器中的脚本也可以应用 ConfigMap 中的 primary.cnfreplica.cnf。 由于示例部署结构由单个 MySQL 主节点和任意数量的副本节点组成, 因此脚本仅将序数 0 指定为主节点,而将其他所有节点指定为副本节点。

    与 StatefulSet 控制器的 部署顺序保证 相结合, 可以确保 MySQL 主服务器在创建副本服务器之前已准备就绪,以便它们可以开始复制。

    2.2 克隆现有数据

    通常,当新 Pod 作为副本节点加入集合时,必须假定 MySQL 主节点可能已经有数据。 还必须假设复制日志可能不会一直追溯到时间的开始。

    这些保守的假设是允许正在运行的 StatefulSet 随时间扩大和缩小而不是固定在其初始大小的关键。

    第二个名为 clone-mysql 的 Init 容器,第一次在带有空 PersistentVolume 的副本 Pod 上启动时,会在从属 Pod 上执行克隆操作。 这意味着它将从另一个运行中的 Pod 复制所有现有数据,使此其本地状态足够一致, 从而可以开始从主服务器复制。

    MySQL 本身不提供执行此操作的机制,因此本示例使用了一种流行的开源工具 Percona XtraBackup。 在克隆期间,源 MySQL 服务器性能可能会受到影响。 为了最大程度地减少对 MySQL 主服务器的影响,该脚本指示每个 Pod 从序号较低的 Pod 中克隆。 可以这样做的原因是 StatefulSet 控制器始终确保在启动 Pod N + 1 之前 Pod N 已准备就绪。

    2.3 开始复制

    Init 容器成功完成后,应用容器将运行。 MySQL Pod 由运行实际 mysqld 服务的 mysql 容器和充当 辅助工具 的 xtrabackup 容器组成。

    xtrabackup sidecar 容器查看克隆的数据文件,并确定是否有必要在副本服务器上初始化 MySQL 复制。 如果是这样,它将等待 mysqld 准备就绪,然后使用从 XtraBackup 克隆文件中提取的复制参数 执行 CHANGE MASTER TOSTART SLAVE 命令。

    一旦副本服务器开始复制后,它会记住其 MySQL 主服务器,并且如果服务器重新启动或 连接中断也会自动重新连接。 另外,因为副本服务器会以其稳定的 DNS 名称查找主服务器(mysql-0.mysql), 即使由于重新调度而获得新的 Pod IP,它们也会自动找到主服务器。

    最后,开始复制后,xtrabackup 容器监听来自其他 Pod 的连接,处理其数据克隆请求。 如果 StatefulSet 扩大规模,或者下一个 Pod 失去其 PersistentVolumeClaim 并需要重新克隆, 则此服务器将无限期保持运行。

    3 发送客户端请求

    你可以通过运行带有 mysql:5.7 镜像的临时容器并运行 mysql 命令, 将测试查询发送到 MySQL 主服务器(主机名 mysql-0.mysql):

    kubectl run mysql-client --image=mysql:5.7 -i --rm --restart=Never --\
      mysql -h mysql-0.mysql <<EOF
    CREATE DATABASE IF NOT EXISTS test;
    CREATE TABLE IF NOT EXISTS test.messages (message VARCHAR(250));
    INSERT INTO test.messages VALUES ('hello');
    EOF
    

    使用主机名 mysql-read 将测试查询发送到任何报告为就绪的服务器:

    kubectl run mysql-client --image=mysql:5.7 -i -t --rm --restart=Never --\
      mysql -h mysql-read -e "SELECT * FROM test.messages"
    

    你应该能看到下面的输出:

    +---------+
    | message |
    +---------+
    | hello   |
    +---------+
    pod "mysql-client" deleted
    

    为了演示 mysql-read 服务在服务器之间分配连接,你可以在循环中运行 SELECT @@server_id

    +-------------+---------------------+
    | @@server_id | NOW()               |
    +-------------+---------------------+
    |         100 | 2021-05-27 03:53:38 |
    +-------------+---------------------+
    +-------------+---------------------+
    | @@server_id | NOW()               |
    +-------------+---------------------+
    |         100 | 2021-05-27 03:53:39 |
    +-------------+---------------------+
    +-------------+---------------------+
    | @@server_id | NOW()               |
    +-------------+---------------------+
    |         100 | 2021-05-27 03:53:40 |
    +-------------+---------------------+
    +-------------+---------------------+
    

    要停止循环时可以按 Ctrl+C ,但是让它在另一个窗口中运行非常有用, 这样你就可以看到以下步骤的效果。

    4 模拟 Pod 和 Node 的宕机时间

    为了证明从副本节点缓存而不是单个服务器读取数据的可用性提高,请在使 Pod 退出 Ready 状态时,保持上述 SELECT @@server_id 循环一直运行。

    4.1 破坏就绪态探测

    mysql 容器的 就绪态探测 运行命令 mysql -h 127.0.0.1 -e 'SELECT 1',以确保服务器已启动并能够执行查询。

    迫使就绪态探测失败的一种方法就是中止该命令:

    kubectl exec mysql-2 -c mysql -- mv /usr/bin/mysql /usr/bin/mysql.off
    

    此命令会进入 Pod mysql-2 的实际容器文件系统,重命名 mysql 命令,导致就绪态探测无法找到它。 几秒钟后, Pod 会报告其中一个容器未就绪。你可以通过运行以下命令进行检查:

    kubectl get pod mysql-2
    

    READY 列中查找 1/2

    NAME      READY     STATUS    RESTARTS   AGE
    mysql-2   1/2       Running   0          3m
    

    此时,你应该会看到 SELECT @@server_id 循环继续运行,但不再报告 102。 回想一下,init-mysql 脚本将 server-id 定义为 100 + $ordinal, 因此服务器 ID 102 对应于 Pod mysql-2

    现在修复 Pod,几秒钟后它应该重新出现在循环输出中:

    kubectl exec mysql-2 -c mysql -- mv /usr/bin/mysql.off /usr/bin/mysql
    

    4.2 删除 Pods

    如果删除了 Pod,则 StatefulSet 还会重新创建 Pod,类似于 ReplicaSet 对无状态 Pod 所做的操作。

    kubectl delete pod mysql-2
    

    StatefulSet 控制器注意到不再存在 mysql-2 Pod,于是创建一个具有相同名称并链接到相同 PersistentVolumeClaim 的新 Pod。 你应该看到服务器 ID 102 从循环输出中消失了一段时间,然后又自行出现。

    4.3 节点宕机

    如果你的 Kubernetes 集群具有多个节点,则可以通过发出以下 drain 命令来模拟节点停机(就好像节点在被升级)。

    或者将节点关机。

    首先确定 MySQL Pod 之一在哪个节点上:

    kubectl get pod mysql-2 -o wide
    
    NAME      READY   STATUS    RESTARTS   AGE   IP           NODE         NOMINATED NODE   READINESS GATES
    mysql-2   2/2     Running   0          49m   10.244.3.2   k8s-node-2   <none>           <none>
    

    如果将节点关机,则不需要执行下面的命令。

    然后通过运行以下命令腾空节点,该命令将其保护起来,以使新的 Pod 不能调度到该节点, 然后逐出所有现有的 Pod。将 <节点名称> 替换为在上一步中找到的节点名称。

    这可能会影响节点上的其他应用程序,因此最好 仅在测试集群中执行此操作

    kubectl drain <节点名称> --force --delete-local-data --ignore-daemonsets
    

    现在,你可以看到 Pod 被重新调度到其他节点上:

    kubectl get pod mysql-2 -o wide --watch
    

    响应类似:

    mysql-0   0/2     Terminating   4          65m   10.244.3.10   k8s-node-3 
    ...
    mysql-0   0/2     Pending       0          0s    <none>        <none>    
    mysql-0   0/2     Pending       0          0s    <none>        k8s-node-4 
    mysql-0   0/2     Init:0/2      0          0s    <none>        k8s-node-4 
    mysql-0   0/2     Init:1/2      0          30m   10.244.4.2    k8s-node-4 
    mysql-0   0/2     PodInitializing   0          30m   10.244.4.2    k8s-node-4 
    mysql-0   1/2     Running           0          30m   10.244.4.2    k8s-node-4 
    mysql-0   2/2     Running           0          30m   10.244.4.2    k8s-node-4 
    

    再次,你应该看到服务器 ID 102SELECT @@server_id 循环输出 中消失一段时间,然后自行出现。

    现在去掉节点保护(Uncordon),使其恢复为正常模式:

    kubectl uncordon <节点名称>
    

    5 扩展副本节点数量

    扩展副本需要先添加对应数量的 PV,如果之前使用的是 StorageClass,则不需要进行此操作。

    使用 MySQL 复制,你可以通过添加副本节点来扩展读取查询的能力。 使用 StatefulSet,你可以使用单个命令执行此操作:

    kubectl scale statefulset mysql --replicas=5
    

    查看新的 Pod 的运行情况:

    kubectl get pods -l app=mysql --watch
    

    一旦 Pod 启动,你应该看到服务器 IDs 103104 开始出现在 SELECT @@server_id 循环输出中。

    你还可以验证这些新服务器在存在之前已添加了数据:

    kubectl run mysql-client --image=mysql:5.7 -i -t --rm --restart=Never --\
      mysql -h mysql-3.mysql -e "SELECT * FROM test.messages"
    
    +---------+
    | message |
    +---------+
    | hello   |
    +---------+
    pod "mysql-client" deleted
    

    向下压缩操作也是很简单:

    kubectl scale statefulset mysql --replicas=3
    

    但是请注意,如果你用的是 StorageClass,按比例扩大会自动创建新的 PersistentVolumeClaims,而按比例缩小不会自动删除这些 PVC。 这使你可以选择保留那些初始化的 PVC,以更快地进行缩放,或者在删除它们之前提取数据。

    你可以通过运行以下命令查看此信息:

    kubectl get pvc -l app=mysql
    

    这表明,尽管将 StatefulSet 缩小为3,所有5个 PVC 仍然存在:

    NAME           STATUS    VOLUME                                     CAPACITY   ACCESSMODES   AGE
    data-mysql-0   Bound     pvc-8acbf5dc-b103-11e6-93fa-42010a800002   10Gi       RWO           20m
    data-mysql-1   Bound     pvc-8ad39820-b103-11e6-93fa-42010a800002   10Gi       RWO           20m
    data-mysql-2   Bound     pvc-8ad69a6d-b103-11e6-93fa-42010a800002   10Gi       RWO           20m
    data-mysql-3   Bound     pvc-50043c45-b1c5-11e6-93fa-42010a800002   10Gi       RWO           2m
    data-mysql-4   Bound     pvc-500a9957-b1c5-11e6-93fa-42010a800002   10Gi       RWO           2m
    

    如果你不打算重复使用多余的 PVC,则可以删除它们:

    kubectl delete pvc data-mysql-3
    kubectl delete pvc data-mysql-4
    

    6 删除本示例

    通过在终端上按 Ctrl+C 取消 SELECT @@server_id 循环,或从另一个终端运行以下命令:

    kubectl delete pod mysql-client-loop --now
    

    删除 StatefulSet。这也会开始终止 Pod。

    kubectl delete statefulset mysql
    

    验证 Pod 消失。他们可能需要一些时间才能完成终止。

    kubectl get pods -l app=mysql
    

    删除 ConfigMap、Services 和 PersistentVolumeClaims。

    kubectl delete configmap,service,pvc -l app=mysql
    

    如果你是手动创建的 PersistentVolume,则还需要手动删除它们,并释放下层资源。 如果你使用了动态预配器,当得知你删除 PersistentVolumeClaims 时,它将自动删除 PersistentVolumes。 一些动态预配器(例如用于 EBS 和 PD 的预配器)也会在删除 PersistentVolumes 时释放下层资源。

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        本文标题:K8S 有状态的应用和示例:多副本MySQL

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