使用augustus进行基因预测 重复序列屏蔽 结果 参考文献:
一、使用Regtag将contig挂到染色体上 二、使用Repeatmasker进行基因组数据屏蔽: 三、基因预测...
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中...
在基因组注释中,预测基因结构是最核心的一环,在众多的从头预测软件中,augustus应用较广。但是由于安装过程依赖...
使用BRAKER2进行基因组注释 BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和...
一、安装 conda一键安装 帮助文档 二、预测基因组重复序列 使用方法 结果 *cat:序列与重复序列比对的文件...
以前做基因组的repeat注释的时候,我一般都是采用repeatmasker/model的,在注释大点的基因组,尤...
BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和转录组数据。 在使用软件之前,有几...
基因结构预测中同源注释策略,将mRNA、cDNA、蛋白、EST等序列比对到组装的基因组中,在文章中通常使用以下比对...
maker结合了重复序列屏蔽,augustus,genemark,snap从头预测,同源注释以及RNA-seq的方...
本文标题:使用augustus、repeatmasker等做基因预测
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ftewrrtx.html
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