在RNAseq数据处理的过程中，有的时候需要写循环或者提交任务到服务器。这个时候vim编辑器就很好用了。
image.png
使用方式：vi + < 文件名>(后缀可以是.sh/.pbs)
vi fastqc.sh
image.png
然后输入i进入输入模式
image.png
输入你的代码， 比如用fastqc批量检测fastq文件的质量并把结果输入到名为qc的文件夹中：
fastqc -t 2 -o ./qc/ *.fastq.gz
image.png
输入完成后，按esc退出输入模式，进入命令模式，然后输入：（冒号）进入底线命令模式，这个时候在输入wq，回车键就保存并退出了。
image.png
最后运行此文件
bash fastqc.sh
在RNAseq数据处理的过程中，有的时候需要写循环或者提交任务到服务器。这个时候vim编辑器就很好用了。 imag...
vim 编辑器之神Emacs 神的编辑器 vim配置 ~/.vimrc 配置文件 vimplugin 管理vim插...
注意：linux命令要小写哦！ 环境 linux系统 vim编辑器 进入VIM编辑器 VIM编辑器，可以新建文件也...
vim 使用使用 VIM 编辑器编写 $vim podfile 创建 Podfile 文件并使用 VIM 编写 执...
目的： 检查从下机fastq.gz文件的完整性 可以只生成MD5文件，但不做检查 可以多线程批量解压fastq.g...
Vim编辑器 vi的使用 鸟哥书籍:按键的说明、Vim的保存文件、恢复与打开时的警告信息 Vim编辑器：文本编辑器...
vim是一款优秀的命令行编辑器。 进入vim vim file：打开或新建文件vim +n file：打开文件，光...
命令 可以启动vim编辑器 一般我们通过 vim+目标文件路径的形式使用vim。如果目标文件存在，则vim打开该文...
本文介绍高通量测序（NGS）中FASTQ文件命名规则、FASTQ格式、FASTA格式、测序质量。首发于本人公众号：...
2019-04-04 vi/vim 编辑文件的编辑器vi/vim 文件 进入编辑1.txt 这个文件 vi/...
本文标题：Vim 编辑器_批量检测fastq文件质量
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/fvaykktx.html
网友评论