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课后补充--关于单细胞突变联合inferCNV的分析

课后补充--关于单细胞突变联合inferCNV的分析

作者: 单细胞空间交响乐 | 来源:发表于2024-06-29 23:50 被阅读0次

    作者,Evil Genius

    我们的课程已经上了4节了,包括单细胞突变、轨迹、CNV和通讯,这一篇做一个联合分析的补充。

    因为方法比较新,所以后续还有有更多使用该方法的文章出现,大家抓住空窗期,发一篇好的文章。

    1、根据肿瘤和正常组织的特征基因表达来计算肿瘤评分
    2、通过使用scRNA-seq数据估计基因组拷贝数变化的算法infercnv计算细胞的拷贝数变异(CNV)分数
    3、单细胞数据中检测肿瘤特异性突变

    其中CNV和突变都已经讲完了,大家要活学活用。多信息来源判断肿瘤的异质性和肿瘤细胞的特征,结果更加准确。

    大家要把学到的东西活学活用,不要拘泥,尤其我们讲到的都是一些新方法,更需要大家大胆使用,前提是大家要有实力😄。

    生活很好,有你更好

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