# 压缩
bgzip view.vcf
# 解压
bgzip -d view.vcf.gz
gunzip view.vcf.gz
# 构建索引
tabix -p vcf view.vcf.gz
# 提取子样本vcf信息
bcftools view -S sample_182 merge.vcf > merge_182.vcf
# 提取vcf样本信息
bcftools query -l your_input.vcf
# 压缩
bgzip view.vcf
# 解压
bgzip -d view.vcf.gz
gunzip view.vcf.gz
# 构建索引
tabix -p vcf view.vcf.gz
# 提取子样本vcf信息
bcftools view -S sample_182 merge.vcf > merge_182.vcf
# 提取vcf样本信息
bcftools query -l your_input.vcf
本文标题:vcf 操作
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/gjtiwdtx.html
网友评论