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2022-04-03用wget下载trinity的singula

2022-04-03用wget下载trinity的singula

作者: 八段锦1134 | 来源:发表于2022-04-03 22:21 被阅读0次

背景

trinity下载里面说了“Singularity is easier and safer to use than Docker, and is our preferred method for running Trinity. ”鉴于docker的镜像(3.7G)比singularity的镜像(2.4G)小,我决定先试一下singularity,而且好像singularity需要sudo的权限要少一些,对于我们这种用学校服务器的人来说最好了,不能多次都卑微的找管理员要权限。

用wget下载

我没下载其他新的下载工具,想先用Linux原有的wget试一试

wget -b -c https://data.broadinstitute.org/Trinity/TRINITY_SINGULARITY/trinityrnaseq.v2.14.0.simg
#发现它自己在服务器的后台运行,即使关了自己电脑,它自己也在服务器继续运行着,然后在前台生产了一个wget-log的日志文件可以随时查看下载进度
$cat wget-log #大文件会刷屏,显示100%就下载完了
$tail -f wget-log # 默认查看最后10行,同时监视文件的变化,一旦变化就实时显示出来,不想看了就ctrl+C退出,继续在前台做事,让它自己下载。

事实证明,虽然wget是单线程,但胜在随手急用,而且后台运行很方便啊。服务器上下了一晚上,第二天一早起来开电脑连上服务器一看,就发现100%了,搞定。

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