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生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

作者: lamyusam_ | 来源:发表于2020-06-18 20:40 被阅读0次

    新手上路

    依然清晰地记得,当初为了在Windows系统中安装R语言学习环境耗费了我多少精力,走了多少弯路最终才得以正常运行...

    1.R语言下载

    国内镜像站点下载Windows版本

    • 我之前下载的是3.6.2版本 ,目前已经更新到4.0.1版本

    • R控制台类似Linux图形界面中的终端模拟器

    • 利用GUI(Graphical User Interface,图形用户界面)选项对操作界面进行个性化设置


      操作界面

    2.Rstudio下载

    这个没有国内镜像站点,只能从官网下载,下载速度感人。

    • Rstudio安装需要电脑用户名为英文,中文用户名则需要修改为英文,否则无法安装。
    • Rstudio 分为四个工作区域
      1.左上窗口可以新建脚本文件
      2.左下窗口是R的控制台(主要操作区域)
      3.右上窗口是用来记录环境变量和历史命令
      4.右下窗口可以显示文档、绘图、帮助文档等窗口等
    • ToolsGlobal OptionsAppearance 个性化设置,如主题颜色,字体大小等。
    个性化设置

    经过反复尝试后,终于看起来舒服一些~


    操作界面

    R语言的工作环境配置完成之后,开始正式进入R语言的学习。

    3.R语言基本操作

    设置工作目录——新建project


    如图,我设置成了桌面。
    这一步也可以通过setwd函数完成
    setwd(dir = "C:/Users/dell/Desktop")
    
    • dir函数查看工作目录下的文件列表

      可以列出我的桌面上存在的所有对象。这相当于linux中的ls命令,但又与linux中有所区别,在Rstudio中需要在命令后加(),代表调用这个函数,括号里面可以输入参数。
    • getwd函数查看工作目录

    相当于linux中的pwd命令

    赋值

    < -对变量进行赋值
    < -可以分别敲<-,也可以同时敲Alt-

     #令 a=123,b=321,c=a+b ,分别输出a,b,c
    a < - 123
    b <-  321
    c <-  a+b
    a
    b
    c
    

    效果:

    简单函数作图

    • R语言中的runif()函数用于生成从0到1区间范围内的服从正态分布的随机数,每次生成的值都不一样。如runif(5)就是生成6个随机数,如下图所示:


    • R语言中的基本绘图plot函数,可以绘制不同的图形,语法为:plot(x轴,y轴,图形type类型),一般情况下,x轴和y轴都是数值类型;如果type参数省略,代表的是点图。
      实例具体说明:
    plot(runif(50))
    

    效果:

    参考:

    今日小结

    • R语言是一个全面的统计学分析平台,提供了各种各样的数据分析技术。
    • R有着强大的绘图功能
    • 生信的数据分析迫切需要掌握R语言

    R语言的学习才刚刚开始……给自己加个油!

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