美文网首页生信星球培训第六十六期
生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

作者: lamyusam_ | 来源:发表于2020-06-18 20:40 被阅读0次

新手上路

依然清晰地记得,当初为了在Windows系统中安装R语言学习环境耗费了我多少精力,走了多少弯路最终才得以正常运行...

1.R语言下载

国内镜像站点下载Windows版本

  • 我之前下载的是3.6.2版本 ,目前已经更新到4.0.1版本

  • R控制台类似Linux图形界面中的终端模拟器

  • 利用GUI(Graphical User Interface,图形用户界面)选项对操作界面进行个性化设置


    操作界面

2.Rstudio下载

这个没有国内镜像站点,只能从官网下载,下载速度感人。

  • Rstudio安装需要电脑用户名为英文,中文用户名则需要修改为英文,否则无法安装。
  • Rstudio 分为四个工作区域
    1.左上窗口可以新建脚本文件
    2.左下窗口是R的控制台(主要操作区域)
    3.右上窗口是用来记录环境变量和历史命令
    4.右下窗口可以显示文档、绘图、帮助文档等窗口等
  • ToolsGlobal OptionsAppearance 个性化设置,如主题颜色,字体大小等。
个性化设置

经过反复尝试后,终于看起来舒服一些~


操作界面

R语言的工作环境配置完成之后,开始正式进入R语言的学习。

3.R语言基本操作

设置工作目录——新建project


如图,我设置成了桌面。
这一步也可以通过setwd函数完成
setwd(dir = "C:/Users/dell/Desktop")
  • dir函数查看工作目录下的文件列表

    可以列出我的桌面上存在的所有对象。这相当于linux中的ls命令,但又与linux中有所区别,在Rstudio中需要在命令后加(),代表调用这个函数,括号里面可以输入参数。
  • getwd函数查看工作目录

相当于linux中的pwd命令

赋值

< -对变量进行赋值
< -可以分别敲<-,也可以同时敲Alt-

 #令 a=123,b=321,c=a+b ,分别输出a,b,c
a < - 123
b <-  321
c <-  a+b
a
b
c

效果:

简单函数作图

  • R语言中的runif()函数用于生成从0到1区间范围内的服从正态分布的随机数,每次生成的值都不一样。如runif(5)就是生成6个随机数,如下图所示:


  • R语言中的基本绘图plot函数,可以绘制不同的图形,语法为:plot(x轴,y轴,图形type类型),一般情况下,x轴和y轴都是数值类型;如果type参数省略,代表的是点图。
    实例具体说明:
plot(runif(50))

效果:

参考:

今日小结

  • R语言是一个全面的统计学分析平台,提供了各种各样的数据分析技术。
  • R有着强大的绘图功能
  • 生信的数据分析迫切需要掌握R语言

R语言的学习才刚刚开始……给自己加个油!

·

相关文章

  • 生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

    新手上路依然清晰地记得,当初为了在Windows系统中安装R语言学习环境耗费了我多少精力,走了多少弯路最终才得以正...

  • 生信学习小组Day5笔记-lamyusam_

    R语言学习 今天,了解了R中的数据类型,初步学习R语言的数据结构。 R的数据类型 向量(vector) R语言中的...

  • 生信学习小组Day1笔记-lamyusam_

    前言 本科毕业已经一周有余,每当闭上眼,过往的点点滴滴便开始如电影般清晰地在脑海中放映。回首过往的岁月,有苦也有甜...

  • 生信学习小组Day6笔记-lamyusam_

    R包学习 R语言的一大特点就是拥有许许多多的第三方扩展包,这些包可以从官方网站下载,但由于速度限制,需要在Rstu...

  • 生信学习小组Day3笔记-lamyusam_

    是一个管理软件的工具,类似于“应用商店”的概念,目前已成为很好的生物软件管理工具。今天从Miniconda入手,开...

  • 生信学习小组Day2笔记-lamyusam_

    2020/6/16学习生物信息,Linux是必须掌握的内容正所谓:"万事开头难,后面更难..." 在得到花花给的腾...

  • 生信学习小组Day7笔记-lamyusam_

    在生信星球的学习小组里,每一天的生活可以用两个字形容——“充实”花花给我们制定了很有层次的学习计划,内容有详有略、...

  • 学习小组Day4笔记--kan

    笔记来自生信星球学习小组资料 Day4 学习内容-R语言初上手 1.思维导图镇楼 2.准备工作 安装R与Rstud...

  • Day-1--小陈

    生信星球-小组学习-day1 ##小陈 1.关于学习方法 学习、索引、小组讨论、正确提问、笔记、总结;心得 2...

  • 2020-05-14

    学习小组DAY4笔记-lyq 今天初探R语言 R语言安装 R语言面板在简单了解

网友评论

    本文标题:生信学习小组Day4笔记-lamyusam_

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/glkuxktx.html