参考:Ka/Ks
参考:Ka/Ks[https://mp.weixin.qq.com/s/qkDOyTPSdA79u6wZ8zvsgw]
选择压力及基因在进化过程中所受到的压力,也称自然选择。 在遗传学中, Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频...
1.准备文件1)需要蛋白文件和编码蛋白的核酸序列,文件格式fasta格式,对应的蛋白和核酸的id要一样 2)同源蛋...
前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献,其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值,(...
1.Ka/Ks与分子进化常用软件:https://www.cnblogs.com/ace9/archive/201...
kaks_calculator可用来计算ka,ks值,后续可计算分化时间点等。 安装 安装ParaAT 在安装ka...
Ka/Ks 在遗传学中,Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换(Ka)和同意替换(Ks)之间的比例。这个比例可以...
此前介绍利用Kaks_calculator计算ka/ks 值,本次对paml 进行计算kaks做一简单介绍。 软件...
今儿来讲一哈利用Paml计算收到正选择的基因因为很多的基因 Ka/Ks 都要小于1 我们用P值来定义是否受到正选择...
写在前面 来来去去,这个主题相关的,我已经写过很多个推文,甚至还包括与Raindy(福建农林高芳銮老师)合作开发和...
本文标题:Ka/Ks(进化选择压力)基础知识与计算
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/gpfpaktx.html
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