最近做了一个似乎有些无聊的事情,就是分析RNA-seq的差异基因在染色体上的密度分布。为什么说无聊呢?因为不知...[作者空间]
ESPript3.0网址:https://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/E...[作者空间]
1.划分窗口bedtools makewindows -g Chr.length -w 50000 > 50k.w...[作者空间]
# 1. gff2bed和gtf2bed[#1-%E8%BF%99%E6%98%AF%E4%B8%80%E7%BA...[作者空间]
RNA世界假说(RNA world hypothesis): 认为RNA是地球早期生命分子,这些早期分子同时拥有D...[作者空间]
有了R语言的基础,以及ggplot2绘图基础,我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了!本系列,师兄就开始带着...[作者空间]
1,ORF简介 开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)从起始密码子开始,到终止密码子结束的连续...[作者空间]
1. 一二三代主流测序仪原理合集 链接:https://pan.baidu.com/s/18gzuKTR_Cuob...[作者空间]
在我们得到SNP位点的VCF文件,想要查看某个SNP位点其在蛋白序列哪一个位点,以了解该位点氨基酸突变的情况时,遇...[作者空间]
一、contigs Contigs译为“重叠群”,指的是一组连续的重叠DNA序列。测序最初所得即为拥有重叠区的co...[作者空间]
目前我们主要分析的数据还是二代测序的数据,也就是大家经常挂在嘴边的 NGS,而这其中最大的赢家应该算是 illum...[作者空间]
miRNA背景知识 miRNA组学,实际上是RNA-Seq的一种,为非常规转录组。 miRNA种类 miRNA、p...[作者空间]
什么是read? 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序;就是我们测...[作者空间]
SAM (Sequence Alignment/Map) 是存储RNA-seq比对结果的格式。BWA、Bowtie...[作者空间]
关注公众号,桓峰基因 关注公众号,桓峰基因,每天更新不停歇! 有绘图需求的同学可以逛逛桓峰基因小店,店中没有的可以...[作者空间]
曹洋课题组 | Labshare 生物信息学在线软件集锦地址:http://www.labshare.cn/bio...[作者空间]
数据库链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/[https://www.ncbi...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s/bCkZ4L9IJTJTFUWKJMsuFw 来自联川生物 ...[作者空间]
生信分析过程中的文件格式:除了原始测序数据fastq、fasta之外,还有基因组文件fasta格式,基因注释文件g...[作者空间]
网址:https://asia.ensembl.org/index.html[https://asia.ensem...[作者空间]