目前，绝大多数生物信息数据分析 GUI 软件使用下述几门语言开发：
- C++
- Java
- Python
由于 C++ 为编译型语言，编译后往往可得到可执行文件；类似的，python等常常使用 Qt 框架，开发后也可以打包或编译为可执行文件。两者开发出来的执行程序可以直接分发，分发后使用者直接双击就可以使用软件。
Java 与两者不同，绝大多数情况下，为了方便分发或早期跨平台支持，Java 开发出来的几乎所有软件都依赖于 JVM。简单来说，如果要实现双击可执行，那么需要自带 JVM 或环境中有 JVM。通常，我们说安装 Java，实际就是安装一个 Java 运行时环境。
许多常用生信软件依赖于 java环境，比如：
- fastqc
- gatk
- figtree
- stem
- EasyCodeML
......
下述简单介绍如何安装 Java，以 Windows 为例，MacOS 用户可以参考。相关程序安装包已上传过到公共仓库，请自行下载。
打开其中
Java文件夹
双击安装器即可，对于 MacOS 请自行选择
剩余其他一直下一步就可以了
安装完成，点击 关闭 即可
如此，就安装好了。
如要测试，直接
win+R调出运行框。输入cmd
输入
java -version
正常显示版本，说明安装完成。
写在最后
Java 主要是提供一个JVM，此处不做具体生信实践应用。至于共享软件仓库，请参考
https://tbtools.cowtransfer.com/s/97e50e9f762d44
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