二代调研图数据存在污染,去NCBI下载了比对上的菌和植物的基因组,然后cat到一起再进行过滤。
bwa的索引正常建立,但是bwa mem的时候显示不能解析文件。
尝试修改格式化id和将序列转单行,成功解决问题。
下载基因组时,ftp选择G,不要选择R,否则无法解压。
二代调研图数据存在污染,去NCBI下载了比对上的菌和植物的基因组,然后cat到一起再进行过滤。
bwa的索引正常建立,但是bwa mem的时候显示不能解析文件。
尝试修改格式化id和将序列转单行,成功解决问题。
下载基因组时,ftp选择G,不要选择R,否则无法解压。
本文标题:BWA: Parse error reading genome.
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