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记“GO功能注释”流程

记“GO功能注释”流程

作者: Hisaga | 来源:发表于2017-09-22 14:55 被阅读0次

文章转载于 Original 2017-06-12 liuhui 生信百科

http://www.cnblogs.com/xiaojikuaipao/p/7190779.html

所谓的 GO(gene ontology, 基因本体论),是生物学功能注释的一个标准词汇表术语(GO term),将基因的功能分为三部分:

基因执行的分子功能(Molecular Function)

基因所处的细胞组分(Cellular Component)

基因以及参与的生物学过程(Biological Process)

不同的 GO term 间的关系由三类:is_a、part_of和regulates

目前,GO 注释主要有两种方法:

(1)序列相似性比对(BLAST)

(2)结构域相似性比对(InterProScan)

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