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2018-03-08 计算生物学笔记(有点乱)

2018-03-08 计算生物学笔记(有点乱)

作者: 小郑的学习笔记 | 来源:发表于2018-03-08 21:29 被阅读0次

开始:信源
过程:信道
结束:信宿

一个基本模型:
信源 ——编码——信道——解码——信宿

信道 (可能中间产生干扰)

信息量:信息是否可以量化
信息熵:信息在系统中维生

物质熵:
负熵 —— 系统可以维生
正熵 —— 消耗

信息熵:

补充信息
比如说一个人坐牢,给他吃喝,不给他信息补充,信息消耗,直到消亡

信息也是生存的重要因素

一个系统存在(能量,物质,信息)

信息量:

与概率有关系。

A1 A2 A3 A4 A5 A6 A7 A8
1/4 1/4 1/8 1/8 1/16 1/16 1/16 1/16

A1 A2 一组 E0
E00 E01

其余一组 E1

E 1 分两座

E10 ( E100 E101)

E11 ( E1100 E1101 E1110 E1111)

后面的数字 是编码位数。与概率有关系。

hi = log 2 1/pi

hi 就是信息量

假设一段核酸序列(3个一组)
AAA AAC AAG AAT ...

p=1/64

hi = log 4 1/1/64

信息熵:

平均位数 (2+2+3+3+4X4)/8

Pi X log 2 1/p

就是平均位数

若都是等概率的情况
信息熵最大

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