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学习小组day5笔记-镰羲

学习小组day5笔记-镰羲

作者: 镰羲 | 来源:发表于2021-09-28 22:30 被阅读0次

R语言中的数据结构

小知识

  • r赋值 为<- 快捷键为alt +
  • 显示工作路径getwd()
  • 表格在 r 中称为数据框
  • 函数、命令不懂时可以百度,或?read.table查看帮助文档
  • 数据类型:向量(vector)数据框(data frame),矩阵(matrix),数组(array),list
    思维导图.jpg

向量

  • 元素 向量 标量
    元素:数字或字符串 chr
    标量:一个元素组成的变量
    向量:多个元素组成的变量
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
x
  • 提取向量中元素

(1)根据位置

x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

(2)根据数值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

数据框

  • 读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header=T)

sep:字符分割
header:true则excel第一行用于列名称,具体数据从第二行开始;false则第一行即为具体数据

  • 设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

csv和table均为数据框的储存形式,以csv提取具有更好的包容性和通融性。

  • 数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#数据框导出为文件“yu.txt”,分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 

quote:字符串是否使用引号表示,默认为TRUE

  • 变量保存和重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
  • 提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
问题回答

save(X,file="test.RData")报错的原因是,变量赋值是有可能付给了小写的x,而在保存时则找不到大写的X变量。

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