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【陪你学·生信】一些你肯定也用过的生信工具和操作(1)

【陪你学·生信】一些你肯定也用过的生信工具和操作(1)

作者: 番茄随笔 | 来源:发表于2020-08-31 03:34 被阅读0次

    一、学会用PubMed/NCBI等搜索数据库

    1. 通过名字了解一个蛋白

    当我们得到一个氨基酸序列,通过blast发现它可能是个dUTPase,但是我们并不了解什么是dUTPase。这时候,可以用PubMed数据库搜索了解。

    (1)打开网页www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/

    (2)输入名字dUTPase,开始检索。

    (3)然后就可以点进去看文章,了解蛋白了。

    除了关键词,还可以通过作者,年份,领域等缩小范围;甚至再检索时加地名,缩小地理范围,找到距离你比较近的人发的文章。与很多检索数据库一样,输入关键词可以用AND,OR,NOT使你的搜索更贴切。比如【dUTPase[TI] OR pyrophosphatase[TI] NOT Smith[AU]】的含义是关键词是dUTPase或者pyrophosphatase,但是不看作者是Smith的结果。

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