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2022-10-01测序数据量统计

2022-10-01测序数据量统计

作者: AsuraPrince | 来源:发表于2022-10-01 16:44 被阅读0次

1. 需要使用的软件是readfq来计算测序结果文件中的reads数,所以需要先安装readfq软件

https://github.com/billzt/readfq

git clone https://github.com/billzt/readfq.git

编译

gcc -o kseq_fastq_base kseq_fastq_base.c -lz

2. 使用方法很简单

kseq_fastq_base CY-1.1.fq.gz > CY-1.1.fq.gz.Num &

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