1. 需要使用的软件是readfq来计算测序结果文件中的reads数,所以需要先安装readfq软件
https://github.com/billzt/readfq
git clone https://github.com/billzt/readfq.git
编译
gcc -o kseq_fastq_base kseq_fastq_base.c -lz
2. 使用方法很简单
kseq_fastq_base CY-1.1.fq.gz > CY-1.1.fq.gz.Num &
1. 需要使用的软件是readfq来计算测序结果文件中的reads数,所以需要先安装readfq软件
https://github.com/billzt/readfq
git clone https://github.com/billzt/readfq.git
编译
gcc -o kseq_fastq_base kseq_fastq_base.c -lz
2. 使用方法很简单
kseq_fastq_base CY-1.1.fq.gz > CY-1.1.fq.gz.Num &
本文标题:2022-10-01测序数据量统计
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/hlydartx.html
网友评论