1.何谓学术论文？
一篇论文是集假设、数据及结论为一体的系统性阐述，并以此引导读者。论文是研究的核心部分。如果你的一项研究没有产生任何论文，那便等于没有做过一样。“有意义但未发表”就如同“从未存在”一样。
研究的目的在于确切表述并验证假设，从不断的论证中得出结论，并将结论向读者展示。切记，你的研究目的不是简单地“收集数据”。
论文并非只是研究结果的资料储存器，而且也是进一步开展研究的有效框架。如果明确了论文的目的和写作形式，那将对你组织和开展进一步研究大有裨益。一份好的论文提纲对于研究项目具有良好的规划指引作用。在研究的整个过程中，你需要写下提纲并对其进行适应性修改。研究初始，应有主要计划；工作结束，应有充分总结。比起简单收集数据并在完成后才对其进行整理写作的方式，在进程中及时理解、分析、总结并修正显得更为高效。
2.论文提纲
2.1为什么要写提纲？
在此，我必须强调提纲在论文写作、学术研讨及研究规划中的核心地位。我尤其相信，对于大家而言，以提纲为基础进行论文写作是最有效的方法。提纲是一份书面的行文计划，其中包括论文所依赖的数据。事实上，提纲不仅仅是列出各段的文字内容， 而是按照目的、 假说、 结论来精心组织和呈现数据。
提纲的文字以简练为宜。如果我们对提纲中的数据及结构这些细节达成一致意见，那么正文组织起来便相当容易。在提纲细节尚未敲定之时，进行正文写作是毫无意义的。论文写作时，大部分时间花费在正文写作上；而大部分思考是用在整理和分析数据上。动笔之前反复推敲并修改提纲，比起写完全文再反复全面修改，效率自然较高。
我所有的写作，包括论文、报告、项目申请书以及研讨会的幻灯片，都从提纲开始。我建议你们也学会如何使用提纲。
2.2如何写好提纲？
最经典的方法就是拿出一张白纸，随意写下当时脑子里蹦出的与论文有关的任何点子。自问一些显而易见的问题：“我为什么要做这项工作？” “它的意义何在?” “我想要验证哪些假说?” “我实际验证了哪些假说？” “结果如何，是否产生了新的化合方法？” “我进行了哪些测试？” “有哪些化合物，它们是怎么表征的？” 并且勾勒出可能的反应式及图示。抓住这些主要想法非常重要。如果你的研究起初是为了证实一个假说，可是当你仔细审视手头的资料时却发现，这些数据似乎能更好地证实另外一个假说，也不要担心。将这些都写下来，从中选择一个假说、目标、数据相互匹配的最佳组合。时常，论文完成之时，其目的与最初的目的已经不一样了。要知道，很多优秀的科学往往是机会主义与修正主义的碰撞产物。
当你把这些都写在纸上后，拿出另一张纸，将这些思绪按照以下三个方面组织起来：
1.引言
为什么我要做这项工作？主要目的和假说是什么？
2.结果和讨论
结果是什么？化合物是怎样合成与表征的？测试了什么？
3.结论
所有这一切意味着什么？证实或否定了什么假说？我学到了什么？其意义何在？
接下来， 将以上各部分更好地组织起来。尤其着力于整理数据，尽可能用清晰简洁的图表来展示数据。这个过程可能比较慢，因为我可能5次甚至10次尝试以不同的方式去描绘一张图，以求达到最清晰最美观的程度。
最后，把所有这一切 - 内容提纲、表格、草图、方程式，安排好顺序。
当你已经掌握了所有需要的数据，或者明确知道自己还要收集哪些额外的数据，并且有了一个合理的构架，你对这些都感到满意时，请将提纲交给我。简要标注哪些地方还缺数据，你认为（或假设）这些数据大概是什么。如果你的假设是正确的，你将如何解释。我会仔细阅读你的提纲，提出我的观点和修改建议。通常情况下，我们需要四五个来回才能达成一致意见，期间经常还需要补做一些实验。我们的一致意见将确定所有的数据的最终形式或者接近最终形式，也就是说，提纲中的表格、图表等最终将成为论文中的表格、图表。
然后，你就可以开始动笔写，此时的你有信心在写作中用到大部分之前整理的数据。
高效利用你我时间的关键在于，项目开始时尽早彼此交换提纲和意见。千万不要等到数据都收集“完成”了才开始写提纲。研究永无“完成”之日，当研究项目初具雏形时，就应立即开始准备构思论文和提纲，这将节省很多的精力和时间。即使在正式组织成文前，我们突然决定补做重要的其他实验，提纲的写作对于研究仍有指导意义。
2.3提纲的内容
提纲应当包括以下几个部分：
标题
2.作者
3.摘要
这部分先空出来，等到论文完成之后再撰写。
4.引言
第一段或者前两段应该详细写出来。开头尤其需要注意，最理想的状态是能够简洁明了地陈述研究工作的目的及意义。
总体上，引言由以下几个方面构成：
研究目的
研究的意义：为什么重要？
研究背景：有谁做过同样的研究？是以什么样的方式？我们之前做过哪些研究？
指引读者：读者能从中得到什么？哪些想法很独特且有意义？我们采取了哪些策略？
总结：读者应期待怎样的结论？完善的提纲版本应该包括实验部分的所有环节（具体到段落小标题）。
5.结果与讨论
结果和讨论紧密联系。这一部分应该根据主题进行行文组织。不同章节应设有加粗小标题，使得结构清晰，同时便于读者迅速浏览全文，找到自己感兴趣的部分。以下列举一些可用作章节小标题的短语：
烷基硫醇的合成
单层膜的表征
邻二醇结构的绝对构型
滞后现象与表面粗糙度的关系
温度对速率常数的影响
自交换速率随溶剂极化度而降低
尽量使章节小标题具体化并且信息丰富。例如，“自交换速率随溶剂极化度而降低”虽然比“速率测试”字数多，但是对于读者来说更有价值。总的来说，尽量概括出段落主旨：
初始材料的合成
产物的表征
表征方法
测试方法
结果（速率常数，接触角等）
提纲中，不要书写大量的文字，而是将数据安排在合适的位置：文字只是简明地提示每章的主要内容。
章节标题
图表（附说明）
示意图（附说明和脚注）
方程
表格（格式正确）
记住，论文是实验结果的集成，运用图表、方程式和图示清晰简洁地呈现。论文中的文字是为解释数据服务的，因而它是次要的。其余的更多信息则可以通过表格、方程式等去展现，这样的文章短小精悍，通俗易读。
6.结论
应将论文的总结论概括成一系列短语或简短的句子。不要重复结果部分已陈述过的结论，除非有必要作特殊强调。结论不是简单的总结，而是更新更高层次的分析阐述，应该清晰地表现出研究工作的意义。
7.实验部分
包括所有实验部分的章节标题，顺序与结果部分一一对应。
2.4要点总结
尽早写作论文提纲。切勿等到研究“结束”；研究永无“结束”之时。
提纲应通过表格、方程式、图表、图示等易于理解的方式组织数据，而不是纯文字内容。
按照数据重要程度进行排序，而不按时间顺序。论文写作一个重要细节在于各部分权重之分配。初学者往往采取时间顺序来组织行文：他们对实验项目进行详尽的叙述，从宝贵的初始失败经历写起，直至达到成功的巅峰。这是极其错误的方式。应该从最重要的结果开始叙述，如果还有次要的结果，再依次叙述。读者通常不会关心你是如何得出一个问答的结论，而是关注结果本身。短篇幅显然更加易读。
3.文体格式
· 勿将名词用作形容词：
错误用法：
ATP formation；reaction product
正确用法：
formation of ATP （ATP的形成）；product of the reaction（反应产物）
· “this”后面必须接名词，以便明确指代对象。
错误用法：
This is a fast reaction；This leads us to conclude
（这是一个快速反应；这使我们得出结论）
正确用法：
This reaction is fast；This observation leads us to conclude
（这个反应是快速反应；这个观察结果使我们得出结论）
· 描述实验结果一律要用过去时态。
错误用法：
Addition of water gives product.
正确用法：
Addition of water gave product. （加水后生成了产物）
· 尽可能使用主动语态。
错误用法：
It was observed that the solution turned red.
正确用法：
The solution turned red. or
We observed that the solution turned red. (溶液变成了红色)
· 完整描述对比双方
错误用法：
The yield was higher using bromine.
正确用法：
The yield was higher using bromine than chlorine. （用溴比用氯时产出率高。）
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