R语言中两个重要的数据类型：向量和数据框
向量
向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。
1、向量的创建
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
2、从向量中提取元素
根据元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
数据框是一种矩阵形式的数据，但数据框中各列可以是不同类型的数据。
1、创建数据框
建数据框，常用的方式是：读取文件、读取关系表和使用函数创建，此处读取文件创建
读取文件的函数是read.table()
read.table(file = "1.txt",sep = "\t",header = T)
file：读取数据的文件名和路径
seq : 用于指定分隔符，默认值是空字符，行的分隔符是回车和换行；
header：是否读入列名
2、设置行名和列名
X <- read.csv('2.txt')
colnames(X)#查看列名
rownames(X)#查看行名
colnames(X)[1] <- "bioplanet"
X<- read.csv(file="1.txt",sep=" ",header=T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
3、数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
4、变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
5、提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
以上代码参考 生信星球 https://m.umu.cn/session/article/1V74o2510?fwx=1
作业问题回答
save(X,file="test.RData")这句代码如果报错X not found，应该是变量X不存在，应该用load()载入
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