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肿瘤异质性的背景知识

肿瘤异质性的背景知识

作者: 看远方的星 | 来源:发表于2019-01-15 14:38 被阅读85次

    肿瘤异质性定义:

    肿瘤的异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。

    肿瘤的2个主要模型

    1、肿瘤干细胞模型:肿瘤干细胞由干细胞癌变或分化的细胞脱分化后产生,具有自我更新和繁殖的能力,被认为在癌症复发中具有重要作用。

    2、克隆进化模型

    1)选择性进化:一部分肿瘤克隆具有选择性优势,驱动突变积累。

    2)大爆炸模型:肿瘤由一些早期的亚克隆扩增而成,没有后期的选择。

    3)中性进化:肿瘤中原本积累了一些关键的基因组变异(driver mutation),扩增由单个关键基因组事件引发,随后中性进化,在亚克隆中产生大量新突变(passenger mutation)。即,克隆选择发生在肿瘤生长之前。

    4)分支进化模型:肿瘤细胞源于一个共同的祖先,平行进化。

    翻译:
    2018-Computational approaches for inferring tumor evolution from single-cell genomic data 根据单细胞数据库推断肿瘤进化的一种计算方法
    摘要
    肿瘤中的基因组异质性是由突变,高适应性单细胞的选择以及进化的操作成分造成的。精确了解肿瘤的突变异质性和进化轨迹,可以为预测癌症进展和设计个性化治疗提供有用的见解。快速发展的单细胞基因组学领域提供了一个研究肿瘤异质性和最终解决水平进化的机会。在这篇综述中,我们概述了人工单细胞DNA测序方法的现状、由此产生的大规模数据集固有的技术错误以及克服这些错误的计算方法。最后,我们讨论了在单个细胞解决中理解肿瘤内异质性和肿瘤演变的计算和数学方法。
    关键词:单细胞,基因组学,DNA测序,变量检测,系统发育学,肿瘤内异质性,肿瘤演化
    引言:癌症是一种从存在于身体组织中的单个细胞中产生的疾病。由复杂的体细胞突变的相互作用、拷贝数改变(CNAS)和染色体重排驱动。


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