如果说GEPIA搞定了TCGA，那么easyGEO的目标要搞定GEO。
依稀记得刚转到医学做分析的时候，单个基因的生存分析，淘宝报价200一个。
那时候GEPIA横空出世，截止目前应该每个研究肿瘤的，研究TCGA的科研人都用过这个工具。
但是TCGA的数据都是肿瘤，对于非肿瘤的其他疾病或者更多的其他肿瘤数据，这个工具能起到的作用就没那么大了。
更大的痛点在于拥有数据最多的GEO数据库的处理。
GEO数据库其实提供了GEO2R用来做一些简单的分析，帮助客户进行课题设计和基金申请的前期准备工作。
但是这个体验感超级差，还是要借助一点点的基础，而且只是差异分析。
这个点很痛，但是其实并不难。
生信人之前推广过核心基因分析的课程和流程，都是免费给大家的，但是大家利用度还不是很高，原因就是在于编程基础。所以本着轻松生信，快乐科研的基调，我们一步到位直接把核心基因流程内嵌进easyGEO中。
也就是说通过easyGEO，分分钟出来一个课题。
再重复下核心基因流程的整体思路，包括差异分析，网络构建，模块挖掘，预后分析。然后你拿到这些结果基本就可以判断你关注的基因，关注的方向跟你的预期符不符合，感兴趣的基因趋势是否一致等。整个分析过程不超过5分钟。
出来的结果也很人性化，直接就是一个包含矢量图的pdf报告。
最最最重要的，这个工具坚持免费注册，免费让大家使用。所以感兴趣的小伙伴，抓紧注册吧。
网友评论