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Sentieon软件发布202112.05版本更新

Sentieon软件发布202112.05版本更新

作者: chSNP | 来源:发表于2022-08-03 14:25 被阅读0次

    Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型,在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据NGS分析效率和计算精度。

    Sentieon持续为业界提供高性能的NGS数据分析软件。我们根据用户的需求与反馈,持续迭代改进Sentieon软件包。2022年7月29日,Sentieon推出了最新的202112.05版本,具体更新信息如下:

    202112.05版本主要新增功能如下:

    1. 更新了UltimaReadFilter模块;
    2. 在TNscope模块中添加了选项用来控制 adapter trimming;
    3. 在 bwa mem 中添加环境变量以实现bug兼容性;
    4. 在 bin 目录中封装了 STAR 的脚本,以免除在计算脚本中设置 LD_LIBRARY_PATH 的要求。

    修复BUG

    • Solved issue in STAR that printed out extra information with the argument --version.
    • Solved issue in duplex umi consensus that could output zero-length reads.
    • Solved issue in umi consensus that slowed down execution under rare circumstances.

    Sentieon 新版手册及安装包下载链接
    Sentieon 中文介绍

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