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RS-fMRI统计分析及作图入门

RS-fMRI统计分析及作图入门

作者: SnowPye | 来源:发表于2020-07-05 00:50 被阅读0次

    获取统计图

    要做统计分析需要以下数据文件



    第二个检查空间变准化效果,一张一张图片打开,看配准效果好不好,肉眼可见配的不好的就可以直接排除掉。细微的差错视自己的数据要求来抉择。
    第三个检查头动效果,文件夹打开之后,看文本文档“ExcluedeSubjects.txt”,里面会给出头动大于3.0, 2.5 ... 的都有哪个被试
    可以把以上数据分别存入case/control组里面
    接下来可以用RESTplus做t检验:
    打开RESTplus —— statistics analysis —— Two sample t-test —— 添加分组,一定是先导入patient,再倒入group(因为最后的结果是patient-gruop) —— 可以选mask —— compute结束,可以得到一张统计图

    拿到统计图之后怎么办?

    统计图实际上就是为了看一下,两组之间有差异的部分。拿到统计图之后,首先要做的是校正
    GRF校正:打开Theory Correction —— 加入统计map —— 选择mask(全脑的) —— t检验选择双尾,f检验选单尾 —— p写0.001 ,也可以0.005 —— run
    在matlab的窗口里面会生成如下的结果



    意思是要想通过多重比较校正,团块的大小必须大于261voxels
    做完多重比较校正之后,会生成以下文件,我们要用的是最后一个,已经转换为了Z值



    这个nii可以用RESTplus的view来查看
    如果要用这个图,可以进行美化:
    点击template选择CH2,可以加上脑底板
    可以取消勾选crosshair,就可以去掉两掉坐标轴

    Misc里面可以 设置color bar,最小是2,最大20
    Montarge可以选择显示几层
    cluster size里面输入261
    CI Reprot可以导出实验报告
    之后再matlab命令框里面有:团块voxel大小,团块峰值点坐标,

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