主成分分析（PCA）原理及其在生物信息中的应用

原理主要看下面这篇文章，讲得非常到位！还讲到了用R实现的方法（包括手动写代码和包装好的函数）

主成分分析（PCA）原理及R语言实现 | 降维dimension reduction | Principal component analysis - Life·Intelligence - 博客园

PCA的简明含义

这篇文章讲得比较简洁，生物信息分析中常用到PCA的地方：

1）对样本进行质量控制，比如，看看RNA-seq的样本之间是否存在批次效应；

2）取出第一主成分中贡献度比较大的基因代替常见的差异表达分析；

3）降维可视化。