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MySQL:如何快速的查看Innodb数据文件

MySQL:如何快速的查看Innodb数据文件

作者: 重庆八怪 | 来源:发表于2019-10-28 18:26 被阅读0次

    水平有限,有误请谅解

    注意:本文很多输出格式是16进制格式。
    使用版本:MySQL 5.7.22

    经常有朋友问我一些如何查看Innodb数据文件的问题比如:

    • 如果我是UTF8字符集,如果插入字符‘a’到底占用几个字节 ?
    • 主键和普通索引叶子节点的行数据在存储上有哪些区别?
    • 如何证明rowid的存在?
    • 数据中的NULL值如何存储的?
    • char和varchar在存储上的区别?
      ......

    如果要得到答案除了学习源码,可能更加直观的方式就是查看Innodb的ibd数据文件了,俗话说得好“眼见为实”,但是我们知道数据文件是二进制形式的,Innodb通过既定的访问方式解析出其中的格式得到正确的结果。如果我们要去访问这些ibd文件,通常的方式就是可以通过hexdump -Cv这样的命令进行二进制的访问,最初我也是这样访问的,但是看起来眼睛特别难受。因此我写了2个工具:

    • innblock:一个用于解析数据块的工具,能够得到每行的偏移量,并且按照逻辑和物理顺序排序。详细使用方式可以参考 https://mp.weixin.qq.com/s/yfi5XikDJlh6-nS-eoJbcA
      下载地址:https://github.com/gaopengcarl/innblock 除了代码我已经编译好了直接使用即可

    • bcview:一个小工具,用于将数据文件按照既定的大小(比如16K)分块,然后访问每个块的偏移量后指定的字节数,通常我们并不知道记录到底多长,可以设置一个较大的查看字节数。
      下载地址:https://github.com/gaopengcarl/bcview 除了代码我已经编译好了直接使用即可

    有了这两工具可能访问ibd数据文件就更加方便一些了,下面我就使用这两个工具来进行数据文件的查看,来解决开头我们提出的这些问题。

    一、行结构简述

    本文无意解释详细的Innodb文件结构,这样的文章和书籍很多,比如:

    整个系列都是讲解Innodb文件结构的,我们只需要知道普通数据块,除去块级别的开销后,其第一行记录从偏移量94 开始,首先出现的是2个伪列 infimum 和 supremum,它们的位置固定在块的94-120字节,其中94-107为infimum 相关信息,而107到120为supremum相关信息,分别的heap no 为 0和1,它们是逻辑记录的开始和结尾,所有的实际的记录都链接在这一条链表上。

    其中普通记录的大概格式如下:

    格式.jpg

    我暂且将黄色部分称为‘行头’,图中用粉红色标记的innblock每行数据offset的位置,我们发现innblock工具指向的是行头以后实际字段开启的位置

    下面是一个innblock工具典型的部分输出:

    -----Total used rows:3 used rows list(logic):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (3) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 2,delflag:N minflag:0 rectype:3
    -----Total used rows:3 used rows list(phy):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 2,delflag:N minflag:0 rectype:3
    (3) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    

    我们可以找到一行除了infimum和 supremum记录以外的normal记录,并且标记了这样记录字段的起点(offset:128),也就是图中的粉红色部分,但是需要注意的是聚集索引(表本身)而言,如果没有主键前面3列分别为:

    • rowid 6字节
    • trx id 6字节
    • roll ptr 7字节

    如果存在主键则为:

    • 主键 和定义有关
    • trx id 6字节
    • roll ptr 7字节

    关于rowid\trx id\roll ptr的源码中的定义如下:

    #define DATA_ROW_ID 0   /* row id: a 48-bit integer */
    #define DATA_ROW_ID_LEN 6   /* stored length for row id */
    
    #define DATA_TRX_ID 1   /* transaction id: 6 bytes */
    #define DATA_TRX_ID_LEN 6
    
    #define DATA_ROLL_PTR   2   /* rollback data pointer: 7 bytes */
    #define DATA_ROLL_PTR_LEN 7
    
    

    而roll ptr的具体含义可以参考函数trx_undo_decode_roll_ptr如下:

    /***********************************************************************//**
    Decodes a roll pointer. */ 
    //从高位到低位依次是  
    //第1位是否是insert 
    //第2到8位是segmentid
    //第9到40位为page no 
    //第41位到56位为OFFSET
    UNIV_INLINE
    void
    trx_undo_decode_roll_ptr(
    /*=====================*/
        roll_ptr_t  roll_ptr,   /*!< in: roll pointer */
        ibool*      is_insert,  /*!< out: TRUE if insert undo log */
        ulint*      rseg_id,    /*!< out: rollback segment id */
        ulint*      page_no,    /*!< out: page number */
        ulint*      offset)     /*!< out: offset of the undo
                        entry within page */
    {
    ...
        ut_ad(roll_ptr < (1ULL << 56));
        *offset = (ulint) roll_ptr & 0xFFFF; //获取低16位 为OFFSET
        roll_ptr >>= 16; //右移16位
        *page_no = (ulint) roll_ptr & 0xFFFFFFFF;//获取32位为 page no
        roll_ptr >>= 32;//右移32位
        *rseg_id = (ulint) roll_ptr & 0x7F;//获取7位为segment id
        roll_ptr >>= 7;//右移7位
        *is_insert = (ibool) roll_ptr; /* TRUE==1 *///最后一位
    }
    
    

    二、建立测试表

    为了解决文中开头的几个问题,我们来建立测试表如下:

    drop table baguait1;
    create table baguait1(id int primary key,c1 varchar(20) ,c2 varchar(20),c3 char(20)) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8;
    alter table baguait1 add key(c1);
    
    insert into baguait1 values(1,NULL,'gaopeng','gaopeng');
    insert into baguait1 values(2,'gaopeng',NULL,'gaopeng');
    insert into baguait1 values(3,'gaopeng',NULL,NULL);
    insert into baguait1 values(4,'a',NULL,NULL);
    
    mysql> select * from baguait1;
    +----+---------+---------+---------+
    | id | c1      | c2      | c3      |
    +----+---------+---------+---------+
    |  1 | NULL    | gaopeng | gaopeng |
    |  2 | gaopeng | NULL    | gaopeng |
    |  3 | gaopeng | NULL    | NULL    |
    |  4 | a       | NULL    | NULL    |
    +----+---------+---------+---------+
    4 rows in set (0.01 sec)
    

    我们发现这里实际上除了rowid问题还不能包含,其他都包含了,接下来我们使用innblock进行扫描。如下:

    1、扫描数据文件找到主键和普通索引数据块

    [root@gp1 test]# ./innblock baguait1.ibd scan 16
    ···
    Datafile Total Size:114688
    ===INDEX_ID:323
    level0 total block is (1)
    block_no:         3,level:   0|*|
    ===INDEX_ID:324
    level0 total block is (1)
    block_no:         4,level:   0|*|
    
    

    这里实际上323就是聚集索引,324就是普通索引,它们数据块对应是3和4。

    2、扫描聚集索引记录

    [root@gp1 test]# ./innblock baguait1.ibd 3 16
    
    链表部分:
    ==== Block list info ====
    -----Total used rows:6 used rows list(logic):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (3) normal record offset:180 heapno:3 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (4) normal record offset:231 heapno:4 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (5) normal record offset:262 heapno:5 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (6) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 5,delflag:N minflag:0 rectype:3
    -----Total used rows:6 used rows list(phy):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 5,delflag:N minflag:0 rectype:3
    (3) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (4) normal record offset:180 heapno:3 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (5) normal record offset:231 heapno:4 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (6) normal record offset:262 heapno:5 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    

    3、扫描普通索引记录

    [root@gp1 test]# ./innblock baguait1.ibd 4 16
    
    链表部分:
    ==== Block list info ====
    -----Total used rows:6 used rows list(logic):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) normal record offset:126 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (3) normal record offset:173 heapno:5 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (4) normal record offset:137 heapno:3 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (5) normal record offset:155 heapno:4 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (6) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 5,delflag:N minflag:0 rectype:3
    -----Total used rows:6 used rows list(phy):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 5,delflag:N minflag:0 rectype:3
    (3) normal record offset:126 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (4) normal record offset:137 heapno:3 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (5) normal record offset:155 heapno:4 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (6) normal record offset:173 heapno:5 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    
    

    我们发现不管聚集索引还是普通索引均包含了4条普通记录,并且采集到了记录的偏移量,我们需要注意一下这里普通索引的逻辑链表顺序中我们可以看到第4条记录(offset:173 )已经排到了第3位,实际上它是最后插入的,这是因为‘a’字符的顺序肯定是在‘gaopeng’这个字符串之前的。并且第一行记录C1为NULL它在逻辑链表顺序中依然是在第一位。好了下面我们就来将问题逐一解决。

    三、如果我是UTF8字符集,如果插入字符‘a’到底占用几个字节 ?

    在我们的语句中我们最后一条记录插入的数据就是'a',即:

    |  4 | a       | NULL    | NULL    |
    

    我们使用bcview来查看一下聚集索引 (offset 262 )的数据是啥,我们直接从块3的(offset 262 )后查看20个字节,如下:

    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 262 30|grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00262--cnt bytes:30--data is:8000000400000005d970e000000043011061000000000000000000000000
    

    我们来解析一样:

    • 80000004:主键4,8是符号位
    • 400000005d970:trx id 6字节
    • e0000000430110:undo ptr 7字节
    • 61:字符‘a’,ASCII编码

    我们发现后面都是0了,实际上字符‘a’即便在UTF8字符下也只是占用一个字节而已。

    四、主键和普通索引叶子节点的行数据在存储上有哪些区别?

    下面我先总结一下:

    • 主键会包含全部的字段,普通索引只会包含它定义的字段内容
    • 主键会包含trx id和roll ptr,普通索引不会包含
    • 即便不定义主键也会包含一个根据rowid排列的聚集索引,很明显如果不定义普通索引则不会存在
    • 普通索引叶子结点包含了主键或者rowid

    下面我们验证一下,我们来观察第2行数据,即:

    |  2 | gaopeng | NULL    | gaopeng |
    

    在主键上这条记录存在于(offset:180)中,在普通索引这条记录存在于(offset:137)中,下面我们分别解析:

    主键(block 3 offset 180 ):

    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 180 50|grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00180--cnt bytes:50--data is:8000000200000005d96adc00000042011067616f70656e6767616f70656e6720202020202020202020202020070600002000
    

    解析一下:

    • 80000002:主键
    • 00000005d96a:trx id 6字节
    • dc000000420110:undo ptr 7字节
    • 67616f70656e67:第二个字段的‘gaopeng’的ASCII编码
    • 67616f70656e6720202020202020202020202020:第四个字段的‘gaopeng’的ASCII编码,并且因为是char(20)类型因此出现了0X20补足的情况,这实际上也解决了第5个问题,我们可以实实在在的看到这种补足操作,占用了更多的空间。

    这里我们发现这条记录没有第三个字段,因为其为NULL,其包含在NULL位图中,后面我们会说明。

    普通索引(block 4 offset 137 ):

    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 137 20|grep 00000004
    current block:00000004--Offset:00137--cnt bytes:20--data is:67616f70656e67800000020700000020ffd56761
    

    解析如下:

    • 67616f70656e67:‘gaopeng’的ASCII编码
    • 80000002:主键值2

    后面的内容是下一行的行头了,这一点如果不确定可以看看最后一行,最后一行的位置是(offset:173)查看如下:

    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 173 20|grep 00000004
    current block:00000004--Offset:00173--cnt bytes:20--data is:6180000004000000000000000000000000000000
    

    解析为:

    • 61:‘a’的ASCII编码
    • 80000004:主键值4

    后面是0了,我们这里可以看到没有trx id和roll ptr,除了键值以外普通索引还包含了主键。

    五、char和varchar在存储上的区别?

    这一点我在上面已经说了,下面我们还是以第二行数据为例:

    |  2 | gaopeng | NULL    | gaopeng |
    

    其中第1个‘gaopeng’是varchar(20)第2个‘gaopeng’是char(20)下面是他们的存储方式:

    • 67616f70656e67:第二个字段的‘gaopeng’的ASCII编码
    • 67616f70656e6720202020202020202020202020:第四个字段的‘gaopeng’的ASCII编码,并且因为是char(20)类型因此出现了0X20补足20字节的情况,我们可以实实在在的看到这种补足操作,占用了更多的空间。

    不再过多熬述

    六、数据中的NULL值如何存储的?

    这一点还记得‘行头’的NULL位图吗?实际上这个位图会为每一个可以为NULL的字段预留1位的空间,用于标记是否字段的值为NULL,当然至少1字节(8位)。

    +----+---------+---------+---------+
    | id | c1      | c2      | c3      |
    +----+---------+---------+---------+
    |  1 | NULL    | gaopeng | gaopeng |
    |  2 | gaopeng | NULL    | gaopeng |
    |  3 | gaopeng | NULL    | NULL    |
    |  4 | a       | NULL    | NULL    |
    +----+---------+---------+---------+
    
    

    c1\c2\c3均可以为空,因此我们分别访问4条记录聚集索引(block 3)上的NULL位图信息,计算方式如下:

    • 第1行:记录(offset:128)那么128-5(5字节固定)-1(1字节NULL位图)= 122
    • 第2行:记录(offset:180)那么180-5(5字节固定)-1(1字节NULL位图)= 174
    • 第3行:记录(offset:231)那么231-5(5字节固定)-1(1字节NULL位图)= 225
    • 第4行:记录(offset:262)那么262-5(5字节固定)-1(1字节NULL位图)= 256

    好了有了偏移量我们可以使用bcview访问这1字节的NULL位图信息了如下:

    第1行
    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 122 1 |grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00122--cnt bytes:01--data is:01
    转换为二进制为:0000 0001

    第2行
    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 174 1 |grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00174--cnt bytes:01--data is:02
    转换为二进制为:0000 0010

    第3行
    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 225 1 |grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00225--cnt bytes:01--data is:06
    转换为二进制为:0000 0110

    第4行
    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 256 1 |grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00256--cnt bytes:01--data is:06
    转换为二进制为:0000 0110

    下面就是NULL位图的表示方法,1为NULL,我们发现和我们记录中的NULL记录一模一样。

    c3 c2 c1
    第1行 0 0 1
    第2行 0 1 0
    第3行 1 1 0
    第4行 1 1 0

    我们DDL修改字段的NULL属性的时候并不能通过修改数据字典来快速完成,我觉得修改更改ibd文件的实际内容是其中很大的一部分原因。下面是我修改NULL属性的记录,具体参考官方文档。

    设置NULL和NOT NULL属性
    
    都是inplace方式,因为需要修改NULL位图 因此都需要重组,代价较高
    ALTER TABLE tbl_name MODIFY COLUMN column_name data_type NULL, ALGORITHM=INPLACE, LOCK=NONE;
    ALTER TABLE tbl_name MODIFY COLUMN column_name data_type NOT NULL, ALGORITHM=INPLACE, LOCK=NONE;
    
    

    七、如何证明rowid的存在?

    这一点实际上也很好证明,我们先来建立一个不包含主键并且插入一条记录如下:

    drop table baguait1;
    create table baguait1(id int ,c1 varchar(20) ,c2 varchar(20),c3 char(20)) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8;
    
    insert into baguait1 values(1,NULL,'gaopeng','gaopeng');
    
    mysql> select * from baguait1;
    +------+------+---------+---------+
    | id   | c1   | c2      | c3      |
    +------+------+---------+---------+
    |    1 | NULL | gaopeng | gaopeng |
    +------+------+---------+---------+
    1 row in set (0.00 sec)
    
    

    使用innblock扫描发现其只包含了1个块如下:

    [root@gp1 test]# ./innblock baguait1.ibd scan 16
    ...
    Datafile Total Size:98304
    ===INDEX_ID:325
    level0 total block is (1)
    block_no:         3,level:   0|*|
    

    然后扫描这个块如下:

    [root@gp1 test]# ./innblock baguait1.ibd 3 16
    
    ...
    ==== Block list info ====
    -----Total used rows:3 used rows list(logic):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (3) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 2,delflag:N minflag:0 rectype:3
    -----Total used rows:3 used rows list(phy):
    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 2,delflag:N minflag:0 rectype:3
    (3) normal record offset:128 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    

    然后使用bcview查看(offset:128 )这条记录如下:

    [root@gp1 test]# ./bcview baguait1.ibd 16 128 60 |grep 00000003
    current block:00000003--Offset:00128--cnt bytes:60--data is:000001ac310000000005d97fea0000002c01108000000167616f70656e6767616f70656e672020202020202020202020202000000000000000000000
    

    我们来解析一下:

    • 000001ac3100:rowid 6字节,上面的测试中这里是主键定义的相关字段值
    • 00000005d97f:trx id 6字节
    • ea0000002c0110:roll ptr 7字节
    • 80000001:第1个字段值 1
    • 67616f70656e67:第2个字段值 ‘gaopeng’的ASCII编码
    • 67616f70656e6720202020202020202020202020:第4个字段值‘gaopeng’的ASCII编码,并且char有0X20补足20字节。

    最后:

    当然这里只是列举了一些例子来说明工具的使用方式,可以按照你的需求方便的从ibd文件中提取出你感兴趣的信息。

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