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ChIP-seq文献分享（一）：先来一个pipeline

ChIP-seq文献分享（一）：先来一个pipeline

作者: TOP生物信息 | 来源:发表于2019-07-06 23:49 被阅读0次

文献标题：Fish the ChIPs: a pipeline for automated genomic annotation of ChIP-Seq data

该流程可以分为以下五个部分：

  1. quality controls
  2. alignment to a reference genome
  3. peak calling
  4. genomic annotation
  5. generation of raw signal tracks for visualization on the UCSC and IGV genome browsers

详细的步骤如下图所示：

看完整篇文献对ChIP-seq分析有了一个整体的认识。不过这篇文献引用较少，说明用这个流程的人不多，后面再看看有没有更好的流程。

文献标题：Ethylene induces combinatorial effects of histone H3 acetylation in gene expression in Arabidopsis

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    本文标题：ChIP-seq文献分享（一）：先来一个pipeline

    本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/istmhctx.html

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