1 GWAS的目录

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历史

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来自 (ss)GBLUP

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单SNP回归

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求解SNP效应使用

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GWAS的一些细节

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2 遗传评估中的非加性效应

来自Zulma G. Vitezica(INPT/INRAE)

生物效应(biological effects) VS 统计效应(statistical effects)

生物效应-显性或上位效应

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• 不幸的是，我们并不了解所有的基因作用和通路
• 出于多种目的，我们需要做出假设/定义理论
统计效应(statistical effects)

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显性效应本质上是残差
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两对的上位效应例子

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统计和生理效应

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数量性状的遗传结构不能从方差分量分析中推断出来

• 基因的生物上位作用有助于加性和其他遗传变异成分
• 基因作用的种类和方差分量之间没有对应关系。

这些数学公式能够起到什么作用呢？

在不知道真正的作用基因的情况下，这提供了工具

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包含非加性效应的模型GDBLUP及其延伸正在发展中

非加性效应的遗传评估：

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开始之前的准备：

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还有的关系矩阵：

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非加性效应的遗传评估在杂交作物中：

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近交衰退 / 杂种优势

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Runs of homozygosity (ROHs)

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可能的用途

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但是前两种不好

猪上的例子

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肉牛上的例子

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小结

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第三种作用-选配

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猪上的例子（相同品种）

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交配的分配：

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小结

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猪上的例子（不同品种）

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猪的遗传提高

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选配结论

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然而，模拟 F1 杂交（猪）中的交配程序并没有产生额外的性能

总结

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查看综述

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