1日，南北双方和谈代表在沪协议成立一个解决新国家国体问题的“国民议会”，进而讨论组织问题。代表的产生，议定由革命军所占领的14省和清廷所统治的8省，每省各派3人；开会地点，伍廷芳提议在上海召开，唐绍仪表示要向袁内阁请示后才能答复。
孙大总统就职的电报和唐绍仪的请示电报双双飞到袁世凯的手上，袁世凯恍然：南北终是两家！他感觉自己肥大的屁股落了空，肥大的脸上战云腾起，给唐绍仪一个指令：未经许可就同意国民会议的代表权分配办法，越出了代表的职权范围，应视为无效。唐绍仪无奈引咎辞职，袁世凯同意，电请伍廷芳北上直接谈判；伍廷芳则请袁世凯南下，双方和谈变成了电报往还。
2日，孙中山致电袁世凯：北京袁总理鉴：前日抵沪，诸同志皆以组织临时政府之责相属，问其理由，盖以东南诸省欠统一机关，行动非常困难，故以组织临时政府为生存之必要条件。文既审艰虞，义不容辞，只得暂时担任。公方以旋乾转坤自任，即知亿兆属望，而目前之地位，尚不能不引嫌自避。故文虽暂时承乏，而虚位以待之心，终可大白于将来。望早定大计，以慰四万万人之渴望。
袁世凯复电：孙逸仙君鉴：蒸电悉。君主共和问题，现方付之国民公决，所决如何？无从预揣。临时政府之说，未敢与闻。谬承奖诱，惭悚至不敢当，惟希谅鉴为幸。
孙中山再电：袁慰庭君鉴：盐电悉。文不忍南北战争，生灵涂炭，故于议和之举，并不反对。虽民主君主不待再计，而君之苦心，自有人谅之。倘由君之力，不劳战争，达国民之志愿，保民族之调和，清室亦得安乐，一举数善，推功让能，自有公论。文承各省推举，誓词具在，区区此心，天日鉴之，若以文为诱致之意，则误会矣。
3日，选举黎元洪为副总统，确定临时政府组成人员，中华民国临时政府成立，采取总统制，政府官员包括革命派、立宪派和旧官僚3种政治势力。各省代表会议改组为临时参议院，成为临时政府的最高立法机关，推选林森为议长，王正廷为副议长。
临时参议院议决，以武昌革命军后来所采用的五色旗为中华民国的正式国旗，青天白日旗改为海军军旗，武昌革命军初期所用的十八星旗规定为陆军军旗。
独立各省的军政府多数为立宪派和旧官僚所操纵，南京临时政府和身为临时大总统的孙中山，对它们事实上不能行使中央政府的权力。
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