介绍
anaconda相当于linux的一个软件仓库,也相当于一个环境管理器,可以使用conda创建不同环境,安装环境包,而不影响其他环境。
下载和安装
在官网下载anaconda3的安装脚本:
https://www.anaconda.com/products/individual
安装也非常简单,直接:
bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh
然后一路yes即可,我没有选择安装VSCode,因为感觉做生信分析没有必要安装
conda环境管理
conda create -n R4 # 创建名为R4的新环境
conda create -n py2 python=2.7 # 创建python2.7的新环境
conda env list # 查看环境列表
source activate R4 # 进入R4环境
conda 设置清华源:
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
conda clean -i
conda包管理
conda search r-base # 查找包
conda install r-base=4.0.3 # 安装R语言版本4.0.3
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