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帮王老师在服务器上构建基因的系统发育树,一共几十个基因,但是把树传到itol上显示只有不到二十个叶节点。最后我发现是非英文符号在基因ID内,影响可视化树。
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用networkx 画节点图,发现系统不兼容。同样的命令在win 上能出图但是Linux 是空白的图。
nx.draw_networkx_edges(new_graph,
pos,
arrows=False,
style="solid",
edge_color=colors)
上面代码改成,就能成功在Linux上运行。
nx.draw(
new_graph,
pos,
with_labels=False,
node_size=0,
arrows=False,
style="solid",
edge_color=colors,
ax=ax,
)
- linux 目录中出现&*这些特殊符号,进不去目录,我建议目录命名除了英文字母和数字以外只使用英文的_-
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