从零开始的基因组分析自学（四）-测序方法

我们的基因组测序用了HIFI和Hi-C。我一开始只了解了这俩词 但是操作就完全不是我进行的，写到文章里用了什么试剂盒，用什么软件组装，我都不了解。和我对接的老师回答问题惜字如金，没有什么问的欲望。

HiC：HiC-Pro的使用 ｜ HiC辅助基因组组装（一） | 生信技术 (lxz9.com)

Hi-C技术及分析简述 - 简书 (jianshu.com)

HIFI好像是一种公认的准确度较高的测序。HiFi 测序 - 利用 HiFi reads 实现高准确度长读长测序 - PacBio  看了公司的介绍，也没怎么看懂眼见为实：HiFi测序挑战不同类型基因组组装 - 简书 (jianshu.com)HiFi全基因组测序技术 - 简书 (jianshu.com)

我疑惑的点：HIFI和SMRT还有PACBIO是什么关系？SMRT测序文献阅读笔记 - 简书 (jianshu.com)

安诺小课堂之三代测序HiFi模式和CLR模式有何差异_哔哩哔哩_bilibili 看过这个就知道了，HIFI测序是CLR的另一种名称。他会一圈一圈的测 每一圈都是同样的模板就可以自己校正自己，所以准确度很高

我对HIC的的理解是，他是一种辅助组装，需要它的原因是，画圈图的时候要分染色体。因为我也没有原始数据 好像做不了这个分析，到时候让我导跟他要吧。

所以现在的目标还是看文献，看文献中的数据处理方法。

想要了解的：染色体数，GC，甲基化程度，重复序列的共线性比对（用来画圈图）

还有一个问题是让我整合一下18年和21年的数据，可能是都整理成表格的形式，测序质量什么的吧。但是我硬盘没到。。