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scRNA---Day8(Seurat)

scRNA---Day8(Seurat)

作者: 茶馆先生的马褂 | 来源:发表于2020-05-05 10:19 被阅读0次
seurat包安装

安装seurat2.3版本
相关的seurat 3.0 教程:https://satijalab.org/seurat/vignettes.html
https://satijalab.org/seurat/v3.1/pbmc3k_tutorial.html
https://satijalab.org/seurat/essential_commands.html 2.X与3.X版本函数比较
检测counts和meta两个变量是否一致
identical(rownames(meta),colnames(counts))
R语言中判断相等的函数:
x %in% y 这种算法是判断x的每个元素是否在y中出现
x == y 判断每个相对应的元素是否相等
which(x==y) 直接给出相等的元素值
identical(x,y) 精确判断是否相等


一下午就和版本在抗争。。。

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