人的甲基化、基因结构、启动子的一些概念

1、最近整文章遇到个关于甲基化问题
1.1、先来看看啥是甲基化
简单说：DNA分子上多了个甲基。
但是，这个甲基不是随意出现的，它只能结合在特定的位置，这个位置叫做胞嘧啶（Cytosine，简称C）。
如下图所示，胞嘧啶上面多了个甲基。

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那进一步问：啥是CpG位点（CpG site）和CpG岛（CpG island）
先说啥是CpG：CpG是胞嘧啶（C，Cytosine），磷酸（p，phosphoric acid），鸟嘌呤（G，Guanine ）。
其实就是配对的核苷酸。
下图比较明显的解释哈。

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CpG位点（CpG site）：就是每一个这样的核苷酸
CpG岛（CpG island）：包含有很多个CpG位点的DNA片段。

怎么定义CpG岛？
（1）长度大于200bp
（2）G + C含量大于50％
（3）其他条件。。。。。这个我也不是很清楚
人类基因组中CpG岛有哪些特征呢？
（1）人类基因组中约有25,000个CpG岛
（2）约50％的CpG岛位于基因启动子区域，约25％的岛位于基因内，剩下的我也不知道。
（3）人体内约60-70％的基因在其启动子区域中具有CpG岛

2、啥是启动子？（中途插播）
看基因结构。
如下图。

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但是启动子就一定在起始密码子上游吗？
未必。
我猜，这应该可以解释为啥有些甲基化位点在基因内部。
“由RNA聚合酶Ⅲ负责转录的是5SrRNA、tRNA和某些核内小分子RNA（snRNA），其启动子（Ⅲ类）组成较复杂，又可被分为三个亚类。两类5S rRNA和tRNA基因的启动子是内部启动子（internal promoter），位于转录起始位点的下游，都由两部分组成。第三类启动子由三个部分组成，位于转录起始位点上游。”

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3、甲基化（或者CpG岛）是如何影响基因表达的？（再回到甲基化的问题）
来，跟我理思路。
第一、基因的启动子区域存在CpG岛
第二、CpG岛上的CpG位点通常都会多出个甲基
那么，问题来了：
（1）基因启动子区域的CpG岛如何影响基因表达？
请注意，知识点哈！
第一，CpG岛被甲基化会抑制基因的表达。
第二，CpG岛上有很多CpG位点，CpG岛上的多少CpG位点被甲基化，才算这个CpG岛被甲基化。
举个栗子吧。
一个岛上有很多树，每棵树上都可以挂一颗灯。当所有的树上都挂上灯之后，意思到夜晚了，该洗洗睡了，停在岛上的船就休息（不转录）。当所有灯都去掉之后，天亮了，该起床了，停在岛上的船可以出海了（正常转录）。
但是还有一种情况，就是岛上的大部分树上没挂灯，继续出海。或者，大部分挂了灯，选择休息。

无甲基化的情况：

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被甲基化的情况：

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