学习小组D7笔记-年糕

作者: 沏茶年糕团子 | 来源:发表于2020-09-13 17:09 被阅读0次

    今天主要是思维导图


    D7-测序基础知识.png

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    原理部分:

    1. 测序的世界 由生信星球编写,非常详细地介绍了测序的原理,并且在后半部分有linux处理测序数据的教学;强推!!一定要看!!
    2. 【陈巍学基因】视频1:Illumina测序化学原理
    3. 测序技术原理及常用数据格式简介 由美格基因编写,重点看常用数据格式部分
    4. 测序发展史:150年的风雨历程 由生信宝典编写,据说是花花看过写的最好的测序史

    实用网站及工具

    1. FASTX-Toolkit http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/
    • 一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的Fasta/Fastq文件格式转换、统计等命令。
    1. EMBL → Fasta格式转换(在线工具):
      http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html

    2. 常见测序文件格式解析的网站:
      https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format1

    • 该网站包含了各种各样的测序文件格式说明,想了解文件格式各行各列的含义直接找它即可

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