synbreed包安装

作者: 日记本的琉璃 | 来源:发表于2021-08-26 16:35 被阅读0次

synbreed包安装
将marker转成012格式
G矩阵-基因组关系矩阵
01.初始化环境
2017-12-29 技术笔记
构建CentOS httpd RPM包
npm包管理工具使用指南（npm使用教程）
python之munch使用
Ubuntu16.04安装nfs的两种方式
学习R包

R包中的synbreed进行了更新，在原来的carn镜像中不能够找到，打开原来的carn网址提示该包因为要实现regress包的功能已经被移除，可以看到以前的版本，但是笔者测试了一下离线安装，总是会报错。

官网提示

以前版本

离线安装以前的版本报错

新网址链接：http://synbreed.r-forge.r-project.org/ 安装代码：

install.packages("synbreed",repos="http://r-forge.r-project.org") #安装代码

安装这个包还要安装doBY、qtl、LDheatmap、和regress包，我们可以利用BiocManager包工具进行安装

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install() #安装 BiocManager包工具

BiocManager::install(c("regress", "LDheatmap","doBy","qtl")) #安装依赖包

library(synbreed) #使用包

安装成功

synbreed包安装
R包中的synbreed进行了更新，在原来的carn镜像中不能够找到，打开原来的carn网址提示该包因为要实现re...
将marker转成012格式
进行GS前，需要将标记格式转成012格式，0表示低频allele的个数，即M矩阵。在R中有包synbreed和SN...
G矩阵-基因组关系矩阵
构建群体G矩阵参考：synbreed: a framework for the analysis of gen...
01.初始化环境
初始化项目安装需要的包安装基础包安装和配置babel 安装处理css包安装处理html包安装处理图片的包
2017-12-29 技术笔记
centos 安装包类型 yum包安装rpm包安装源码包安装 rpm安装的几个命令 yum安装的几个命令 cent...
构建CentOS httpd RPM包
安装依赖包下载apr及httpd源码包编译apr rpm包安装apr包编译http包安装http包
npm包管理工具使用指南（npm使用教程）
以下使用package表示包名称更新npm 全局安装包本地安装（局部安装）查看已经安装的包查看包信息安装...
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学习R包
安装和加载R包 1. 镜像设置 2. 安装 R包安装命令是install.packages(“包”) 安装的包...