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日常记录:R语言的一些计算和应用

日常记录:R语言的一些计算和应用

作者: bio_橡树 | 来源:发表于2017-12-26 15:54 被阅读0次

    1.把数据框按某列排序
    2.对向量排序
    3.对向量排序并取出累加和在前90%的元素
    4.处理数据并绘制散点图(ggplot2,数据过滤)
    5.合并两个向量,去重,计数
    6.merge函数,按指定列合并数据框
    7.统计向量中元素的频次table()

    1. 把数据框按列A逆向排序
    data[order(-data$A),]
    
    1. 对向量a逆向排序
    sort(x,decreasing=T)
    
    1. 对向量x逆向排序并取出累加和在前90%的元素
    x=sort(x,decreasing=T)    #对向量排序
    k=""
    for (i in 1:length(x)){
        if (sum(x[1:i])>0.9*sum(x)){
            print (i)  ##从大往小累加,到第i个元素和>0.9*sum
            k=i
            break
        }
    }
    sum(x[1:k])
    
    1. 处理数据并绘制散点图


      数据格式data
    data1<-data[data$R7111062+data$R7111063!=0,1:3]   ##过滤掉R7111062和R7111063都为0的行
    data1<-data1[order(-data1$R7111062),]                          ##把数据框按R7111062这一列逆向排序
    head(data1)  
    library(reshape2)
    data1<-melt(data1)                                                          ##数据变形,宽数据变长数据
    png("R7111062vsR7111063.png",width=800,height=1000) 
    ggplot(data1, aes(x=data1$CDR3, y=data1$value, colour=variable)) + geom_point()
    +labs(x="CDR3",y="Count",title = "R7111062vsR7111063")  ##labs可以修改各种坐标轴标题和title
    dev.off()
    

    ![Z@43X9A1]~Y{R3()$B63P`S.png](https://img.haomeiwen.com/i9305347/eae903a754036d34.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)

    1. 合并两个向量并去重复,计数
    a<-c(1,2,3)
    b<-c(2,3,4)
    a+b 结果为(3,5,7)
    c<-c(a,b) 结果为(1,2,3,2,3,4)
    length(unique(c))
    

    6.merge函数,按指定列合并数据框

    merge(x, y ,by.x = ,by.y = ,all= )  #all.x=TRUE, all.y=TRUE , all=TRUE, by=" "
    data1<-data.frame(A=c("a","b","c","d"),B=c(1,2,3,4))
      A  B
    1 a 1
    2 b 2
    3 c 3
    4 d 4
    data2<-data.frame(A=c("c","d","e","f"),C=c(10,20,30,40))
      A C  
    1 c 10
    2 d 20
    3 e 30
    4 f 40
    merge(data1,data2,by="A") 
      A B  C
    1 c 3 10
    2 d 4 20
    
    1. 统计向量中元素的频次table()
    A<-c(rep("a",3),rep("b",2),rep("c",5))
    A: "a" "a" "a" "b" "b" "c" "c" "c" "c" "c"
    table(A)
    A
    a b c
    3 2 5
    as.data.frame(table(A))
      A Freq
    1 a    3
    2 b    2
    3 c    5
    

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