最近又看了一遍SVM算法, 理论主要参考了李航老师的《统计学习方法》, 代码实现上参考了《机器学习实战》和smo算法的原始论文。期间发现《机器学习实战》在实现完整版的Platt SMO有点问题。 网上很多SMO的实现的也是参考书上了,而且其中的问题也基本上保留了下来。
SVM的算法推导这里不解释了,推导在最后变成了求解拉格朗日乘子alpha, 然后求出W, b, 代入sign函数实现分类。具体的推导大家可以看看书或者这个博客。
另外完全参照论文实现了SMO算法, 详见文章。
书中的算法实现
书中的代码和数据也参考了上面的提到的博客。
按照书中的完整版SMO算法实现后, 将随机种子random.seed(10)
设为10,此时分类效果如下:
SVM效果_seed_100.png
从图中可以明显感觉的支持向量找的不对。seed为10时这几个支持向量的对应的alpha为:
[[0.02612257]]
[[0.01109597]]
[[0.09657277]]
[[0.0147441]]
[[0.01547254]]
[[0.13749869]]
[[0.13749869]]
[[0.05132954]]
都不为0,而且也不是特别小,小到了浮点数精度的值。
现在直接看下代码, 书中的错误用 # TODO
进行了标记:
# -*-coding:utf-8 -*-
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import random
"""
Author:
Jack Cui
Blog:
http://blog.csdn.net/c406495762
Zhihu:
https://www.zhihu.com/people/Jack--Cui/
Modify:
2017-10-03
"""
class optStruct:
"""
数据结构,维护所有需要操作的值
Parameters:
dataMatIn - 数据矩阵
classLabels - 数据标签
C - 松弛变量
toler - 容错率
"""
def __init__(self, dataMatIn, classLabels, C, toler):
self.X = dataMatIn # 数据矩阵
self.labelMat = classLabels # 数据标签
self.C = C # 松弛变量
self.tol = toler # 容错率
self.m = np.shape(dataMatIn)[0] # 数据矩阵行数
self.alphas = np.mat(np.zeros((self.m, 1))) # 根据矩阵行数初始化alpha参数为0
self.b = 0 # 初始化b参数为0
self.eCache = np.mat(np.zeros((self.m, 2))) # 根据矩阵行数初始化虎误差缓存,第一列为是否有效的标志位,第二列为实际的误差E的值。
def loadDataSet(fileName):
"""
读取数据
Parameters:
fileName - 文件名
Returns:
dataMat - 数据矩阵
labelMat - 数据标签
"""
dataMat = []
labelMat = []
fr = open(fileName)
for line in fr.readlines(): # 逐行读取,滤除空格等
lineArr = line.strip().split('\t')
dataMat.append([float(lineArr[0]), float(lineArr[1])]) # 添加数据
labelMat.append(float(lineArr[2])) # 添加标签
return dataMat, labelMat
def calcEk(oS, k):
"""
计算误差
Parameters:
oS - 数据结构
k - 标号为k的数据
Returns:
Ek - 标号为k的数据误差
"""
fXk = float(np.multiply(oS.alphas, oS.labelMat).T * (oS.X * oS.X[k, :].T) + oS.b)
Ek = fXk - float(oS.labelMat[k])
return Ek
def selectJrand(i, m):
"""
函数说明:随机选择alpha_j的索引值
Parameters:
i - alpha_i的索引值
m - alpha参数个数
Returns:
j - alpha_j的索引值
"""
j = i # 选择一个不等于i的j
while (j == i):
j = int(random.uniform(0, m))
return j
def selectJ(i, oS, Ei):
"""
内循环启发方式2
Parameters:
i - 标号为i的数据的索引值
oS - 数据结构
Ei - 标号为i的数据误差
Returns:
j, maxK - 标号为j或maxK的数据的索引值
Ej - 标号为j的数据误差
"""
maxK = -1
maxDeltaE = 0
Ej = 0 # 初始化
# TODO error1
oS.eCache[i] = [1, Ei] # 根据Ei更新误差缓存
validEcacheList = np.nonzero(oS.eCache[:, 0].A)[0] # 返回误差不为0的数据的索引值
if (len(validEcacheList)) > 1: # 有不为0的误差
for k in validEcacheList: # 遍历,找到最大的Ek
if k == i: continue # 不计算i,浪费时间
Ek = calcEk(oS, k) # 计算Ek
deltaE = abs(Ei - Ek) # 计算|Ei-Ek|
if (deltaE > maxDeltaE): # 找到maxDeltaE
maxK = k
maxDeltaE = deltaE
Ej = Ek
return maxK, Ej # 返回maxK,Ej
else: # 没有不为0的误差
j = selectJrand(i, oS.m) # 随机选择alpha_j的索引值
Ej = calcEk(oS, j) # 计算Ej
return j, Ej # j,Ej
def updateEk(oS, k):
"""
计算Ek,并更新误差缓存
Parameters:
oS - 数据结构
k - 标号为k的数据的索引值
Returns:
无
"""
Ek = calcEk(oS, k) # 计算Ek
oS.eCache[k] = [1, Ek] # 更新误差缓存
def clipAlpha(aj, H, L):
"""
修剪alpha_j
Parameters:
aj - alpha_j的值
H - alpha上限
L - alpha下限
Returns:
aj - 修剪后的alpah_j的值
"""
if aj > H:
aj = H
if L > aj:
aj = L
return aj
def innerL(i, oS):
"""
优化的SMO算法
Parameters:
i - 标号为i的数据的索引值
oS - 数据结构
Returns:
1 - 有任意一对alpha值发生变化
0 - 没有任意一对alpha值发生变化或变化太小
"""
# 步骤1:计算误差Ei
Ei = calcEk(oS, i)
# 优化alpha,设定一定的容错率。
if ((oS.labelMat[i] * Ei < -oS.tol) and (oS.alphas[i] < oS.C)) or (
(oS.labelMat[i] * Ei > oS.tol) and (oS.alphas[i] > 0)):
# 使用内循环启发方式2选择alpha_j,并计算Ej
j, Ej = selectJ(i, oS, Ei)
# 保存更新前的aplpha值,使用深拷贝
alphaIold = oS.alphas[i].copy()
alphaJold = oS.alphas[j].copy()
# 步骤2:计算上下界L和H
if (oS.labelMat[i] != oS.labelMat[j]):
L = max(0, oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
H = min(oS.C, oS.C + oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
else:
L = max(0, oS.alphas[j] + oS.alphas[i] - oS.C)
H = min(oS.C, oS.alphas[j] + oS.alphas[i])
if L == H:
print("L==H")
return 0
# 步骤3:计算eta
eta = 2.0 * oS.X[i, :] * oS.X[j, :].T - oS.X[i, :] * oS.X[i, :].T - oS.X[j, :] * oS.X[j, :].T
if eta >= 0:
print("eta>=0")
return 0
# 步骤4:更新alpha_j
oS.alphas[j] -= oS.labelMat[j] * (Ei - Ej) / eta
# 步骤5:修剪alpha_j
oS.alphas[j] = clipAlpha(oS.alphas[j], H, L)
# 更新Ej至误差缓存
# TODO error2
updateEk(oS, j)
if (abs(oS.alphas[j] - alphaJold) < 0.00001):
print("alpha_j变化太小")
return 0
# 步骤6:更新alpha_i
oS.alphas[i] += oS.labelMat[j] * oS.labelMat[i] * (alphaJold - oS.alphas[j])
# 更新Ei至误差缓存
# TODO error2
updateEk(oS, i)
# 步骤7:更新b_1和b_2
b1 = oS.b - Ei - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.X[i, :] * oS.X[i, :].T - oS.labelMat[j] * (
oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.X[i, :] * oS.X[j, :].T
b2 = oS.b - Ej - oS.labelMat[i] * (oS.alphas[i] - alphaIold) * oS.X[i, :] * oS.X[j, :].T - oS.labelMat[j] * (
oS.alphas[j] - alphaJold) * oS.X[j, :] * oS.X[j, :].T
# 步骤8:根据b_1和b_2更新b
if (0 < oS.alphas[i]) and (oS.C > oS.alphas[i]):
oS.b = b1
elif (0 < oS.alphas[j]) and (oS.C > oS.alphas[j]):
oS.b = b2
else:
oS.b = (b1 + b2) / 2.0
return 1
else:
return 0
def smoP(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter):
"""
完整的线性SMO算法
Parameters:
dataMatIn - 数据矩阵
classLabels - 数据标签
C - 松弛变量
toler - 容错率
maxIter - 最大迭代次数
Returns:
oS.b - SMO算法计算的b
oS.alphas - SMO算法计算的alphas
"""
oS = optStruct(np.mat(dataMatIn), np.mat(classLabels).transpose(), C, toler) # 初始化数据结构
iter = 0 # 初始化当前迭代次数
entireSet = True
alphaPairsChanged = 0
while (iter < maxIter) and ((alphaPairsChanged > 0) or (entireSet)): # 遍历整个数据集都alpha也没有更新或者超过最大迭代次数,则退出循环
alphaPairsChanged = 0
if entireSet: # 遍历整个数据集
for i in range(oS.m):
alphaPairsChanged += innerL(i, oS) # 使用优化的SMO算法
print("全样本遍历:第%d次迭代 样本:%d, alpha优化次数:%d" % (iter, i, alphaPairsChanged))
iter += 1
else: # 遍历非边界值
nonBoundIs = np.nonzero((oS.alphas.A > 0) * (oS.alphas.A < C))[0] # 遍历不在边界0和C的alpha
for i in nonBoundIs:
alphaPairsChanged += innerL(i, oS)
print("非边界遍历:第%d次迭代 样本:%d, alpha优化次数:%d" % (iter, i, alphaPairsChanged))
iter += 1
if entireSet: # 遍历一次后改为非边界遍历
entireSet = False
elif (alphaPairsChanged == 0): # 如果alpha没有更新,计算全样本遍历
entireSet = True
print("迭代次数: %d" % iter)
return oS.b, oS.alphas # 返回SMO算法计算的b和alphas
def showClassifer(dataMat, classLabels, w, b):
"""
分类结果可视化
Parameters:
dataMat - 数据矩阵
w - 直线法向量
b - 直线解决
Returns:
无
"""
# 绘制样本点
data_plus = [] # 正样本
data_minus = [] # 负样本
for i in range(len(dataMat)):
if classLabels[i] > 0:
data_plus.append(dataMat[i])
else:
data_minus.append(dataMat[i])
data_plus_np = np.array(data_plus) # 转换为numpy矩阵
data_minus_np = np.array(data_minus) # 转换为numpy矩阵
plt.scatter(np.transpose(data_plus_np)[0], np.transpose(data_plus_np)[1], s=30, alpha=0.7) # 正样本散点图
plt.scatter(np.transpose(data_minus_np)[0], np.transpose(data_minus_np)[1], s=30, alpha=0.7) # 负样本散点图
# 绘制直线
x1 = max(dataMat)[0]
x2 = min(dataMat)[0]
a1, a2 = w
b = float(b)
a1 = float(a1[0])
a2 = float(a2[0])
y1, y2 = (-b - a1 * x1) / a2, (-b - a1 * x2) / a2
plt.plot([x1, x2], [y1, y2])
# 找出支持向量点
for i, alpha in enumerate(alphas):
if abs(alpha) > 0:
print(alpha)
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='red')
plt.show()
def calcWs(alphas, dataArr, classLabels):
"""
计算w
Parameters:
dataArr - 数据矩阵
classLabels - 数据标签
alphas - alphas值
Returns:
w - 计算得到的w
"""
X = np.mat(dataArr)
labelMat = np.mat(classLabels).transpose()
m, n = np.shape(X)
w = np.zeros((n, 1))
for i in range(m):
w += np.multiply(alphas[i] * labelMat[i], X[i, :].T)
return w
if __name__ == '__main__':
random.seed(10)
dataArr, classLabels = loadDataSet('testSet.txt')
b, alphas = smoP(dataArr, classLabels, 0.6, 0.001, 100)
w = calcWs(alphas, dataArr, classLabels)
showClassifer(dataArr, classLabels, w, b)
Error1
oS.eCache[i] = [1, Ei] # 根据Ei更新误差缓存
validEcacheList = np.nonzero(oS.eCache[:, 0].A)[0] # 返回误差不为0的数据的索引值
这段代码的目的是找alpha2, 而alpha2是在那些“非0非C的alpha“(if (number of non-zero & non-C alpha > 1)
)中寻找。原始代码中第一行更新缓存差不应该在这里更新, 第二行不应该在缓存差中找alpha。
应更改为:
# oS.eCache[i] = [1, Ei] # 根据Ei更新误差缓存
validEcacheList = np.nonzero(oS.alphas)[0] # 返回误差不为0的数据的索引值
Error2
# TODO error2
updateEk(oS, j)
updateEk(oS, i)
这两行代码是更新缓存差的, 但是位置不对, 原始代码中这两行在更新b之前, 所以此时更新是用新的剪辑过alpha1、alpha2和b_old计算的E1、E2, 这两行代码应该放在更新b之后。
修改后的分类效果
直接看图
改正SVM效果_seed_10.png
改正SVM效果_seed_100.png
改正后不同随机种子分类效果基本相同, 支持向量找的就是这几个。·
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