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2018-12-24 群体遗传基础学习记录(一)

2018-12-24 群体遗传基础学习记录(一)

作者: 小郑的学习笔记 | 来源:发表于2018-12-24 15:21 被阅读93次

这几天梳理了一下群体遗传的一些基础知识,还是要好好推导一下公式,特别是矩阵什么的,这个数学公式不是很会打,所以直接拍照记录了。


方差与均值.jpeg

我们要搞清楚的是
基因型分成三种 AA Aa aa
p q 是 等位基因频率 (A a)
这里很多概念都是一个位点在群体里面的情况
群体分为两种极限群体,自交群体和自由交配群体
其每个位点的认为编码为 0 1 2
均值与方差都是可以推算出来的
均值都是 2q
方差 自由交配的是 2pq 自交的是 4pq
以上都是理论状态下的情况

F近交系数.jpeg

这里引入一个近交系数F
要搞清楚这里的自交,不是自己和自己交配的概念,而是不是随机交配的情况,所以存在近亲繁殖的现象,那么 F=0 F=1 就是前面所说的两种极端情况。

一个群体的F 是可以计算出来的
群体中实际观测杂合位点的频率除以期望的频率 就是 1- F
我们就可以倒推出 F的大小

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