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Assembly数据库 和genome数据库的区别

Assembly数据库 和genome数据库的区别

作者: 扇子和杯子 | 来源:发表于2020-06-01 18:33 被阅读0次

1. Assembly数据库

Assembly数据库提供以下信息:

  • 组装基因组结构
  • 组装名称
  • 其他的元数据
  • 组装报告
  • 基因组序列

2. Genome数据库

Genome数据库提供以下信息:

  • 基因组序列
  • map信息
  • 染色体信息
  • 组装信息
  • 注释信息

备注:

  1. map和annotation的区别
    map通常是把短的reads比对到reference genome上,可以是转录组或基因组。
    annotation则是寻找序列的生物学意义。

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