一般来说,TCGA差异分析或者其他分析时,使用的是包含所有肿瘤样本和正常样本。但是,一般情况下,多数类型的TCGA...
从果子老师的从TCGA数据中提取lncRNA并进行下游分析一文中,我学到了如何从TCGA表达谱数据中提取RNA。老...
下载TCGA FPKM数据 下载TCGA临床数据 XENA官网下载整合好的数据 整理表达矩阵 提取mRNA和gen...
本文目的: 解决纯R语言代码版本下载最新前体或者成熟体miRNA表达矩阵(TCGA数据库) 解决零代码如何下载最新...
1. 下载GEO数据 2. 注释及得到基因表达矩阵 3. 提取配对样本数据 5. 计算配对样本T检验及wilcox...
在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵(2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jia...
0.需求 TCGA里的数据tumor多normal少,想要挑选出配对样本进行差异分析。(并不是说必须挑配对样本才能...
做差异分析需要的数据:表达矩阵和分组信息TCGA的数据只要表达矩阵就够了,因为其TCGA的样本ID比较特殊,样本I...
前面给大家讲解过新版的TCGA数据库中,RNAseq的表达矩阵中加入了一列gene type。 ☞[https:/...
本文首发于公众号:医学和生信笔记 医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用,R语言数据分析和可视化。主要分享R...
本文标题:一文解决如何提取TCGA配对表达矩阵
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