上传数据到proteomexchange

上传蛋白质组学数据到proteomexchange

1. 登录网址http://proteomecentral.proteomexchange.org

2. 用邮箱注册自己的账户。

3. 下载上传软件：px-submission-tool.zip。本文主要介绍的是PRoteomics IDEntifications (PRIDE)数据库。PRIDE是ProteomeXchange (PX)旗下的一个数据库，是全世界最大的蛋白质组学数据库。

4. 安装。双击px-submission-tool-2.4.15.jar文件，完成安装。

5. 登录。用PX网站注册的用户名和密码登录。注意，初始密码会发送到注册邮箱，查收邮件。

6. 按照步骤的要求填写、上传原始文件即可。上传完成后，大概需要一周时间审核，才能给一个accession number. 需要保障网速，我第一次上传最后一步失败了，可能是晚上用网人多，第二天早上再上传就成功了。

7. 引用开发者的文献如下：2016年开发，2019年更新升级了一次。The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data, Nucleic Acids Res, 2019, Perez Riverol, Y. Csordas, A. Bai, J. Bernal-Llinares, M.

上传数据逐年剧增 截至2018年底，人和小鼠的数据较多，其次是拟南芥